Respuestas:
La diferencia entre [ellos] es si tiene ciertos caracteres especiales en los campos de texto; por ejemplo, un carácter acentuado (idioma extranjero). Si exporta como CSV de Windows, esos campos se codifican utilizando la página de códigos de Windows-1252. La codificación DOS generalmente usa la página de códigos 437, que asigna los caracteres utilizados en las PC anteriores a Windows. Si exporta como uno y luego importa con una herramienta que espera el otro, la mayoría de las cosas se verán bien, pero obtendrá resultados inesperados si, por ejemplo, conoce a alguien con una diéresis (u otro carácter extranjero) en su nombre.