Respuestas:
Omita el modificador "/ F", ya que es lo que hace que se incluyan los archivos.
De tree /?
:
Graphically displays the folder structure of a drive or path.
TREE [drive:][path] [/F] [/A]
/F Display the names of the files in each folder.
/A Use ASCII instead of extended characters.
para enviar al archivo txt, use el comando: (encontrará en la unidad C, como se especifica a continuación)
tree /a > "C:\_TREE-Output.txt"
>
parte que la otra respuesta no tiene.