Utilizando dir /x, continúe en la estructura (a medida que avanza, cambie el nombre de estos directorios a algo más simple copiando y pegando sus viejos nombres de dos y poniendo "CRAP" en su lugar, como este REN 99A4 ~ 1 CRAP)
Llegará a un punto en el que ya no podrá ir más lejos, pero hay más archivos.
Use el explorador de Windows esta vez para desglosar las carpetas hasta que le digan que no tiene permisos, use la pestaña de seguridad y tome posesión del directorio y todos sus subdirectorios).
Ahora puede eliminar el lote.
No es necesario arrancar con Linux.