Tengo este problema por dos días ahora. Primero, cuando sucedió, cerrar la sesión y volver a iniciarla ayudó, pero ahora esto ocurre justo después del arranque. No puedo activar ninguna ventana haciendo clic en ella, y tampoco puedo minimizarla o cerrarla con el mouse. En algunas aplicaciones, ni siquiera puedo interactuar con ellos con el mouse (por ejemplo, haciendo clic en los enlaces del navegador). Puedo desplazar una ventana activa con el trackball, y a veces todo funciona normalmente por un tiempo. Todo funciona bien, cuando uso el teclado para esto, puedo cambiar el tamaño, mover, cerrar ventanas con atajos de teclado, etc.
Corrí un completo Avast! escanear, pero no encontró nada importante. Además, el visor de eventos no mostró ningún error relevante. Aquí hay un registro de HijackThis si ayuda en algo.