Cada fragmento tiene que ser rastreado en alguna parte. Eso ocupa espacio de almacenamiento (dentro de la plomería del sistema de archivos, no cosas a las que debes acceder directamente).
Un ejemplo: supongamos que tiene un solo archivo con 1000 fragmentos. Por lo tanto, su archivo se almacena a través de una colección de bloques aleatorios. En lugar de en un solo bloque continuo. Esto significa que el archivo fragmentado requiere 1000 veces más espacio de almacenamiento dentro de la tubería del sistema de archivos, aunque solo sea para almacenar direcciones para cada fragmento. La plomería del sistema de archivos mantiene pequeños diccionarios / bases de datos / mapas / tablas / listas en la ubicación de cada fragmento del archivo. Por lo tanto, para la plomería del sistema de archivos, almacenar una lista de un puntero de fragmento único no necesita mucho espacio, en comparación con una lista de 1000 punteros de fragmento.
Pero bueno, tal vez me equivoque ...
Editar: información de apoyo desde aquí :
Cuando un flujo de datos no residente está demasiado fragmentado, de modo que su mapa de asignación efectivo no puede caber completamente dentro del registro MFT, el mapa de asignación también puede almacenarse como un flujo no residente, con solo un pequeño flujo residente que contiene la asignación indirecta asignar al mapa de asignación efectivo de no residentes del flujo de datos de no residentes.
Traducción: si tiene una gran fragmentación, no se aplicarán los supuestos generales del caso de la plomería del sistema de archivos. Como tal, el FS debe tomar medidas para acomodar la fragmentación y terminar costando espacio de almacenamiento adicional, solo para administrar los fragmentos. Exactamente mi suposición desde el primer lugar.
Editar: Teniendo en cuenta lo anterior, todavía parece que perder 10GB solo por fragmentación de archivos es una locura. Apuesto a que durante la desfragmentación, tuvo algún daño común en el sistema de archivos que se corrigió automáticamente. Creo que no solo tuvo una fragmentación masiva, sino que también eliminó parcialmente archivos que ocupaban espacio de almacenamiento. Hubiera sido agradable ver un registro de scandisk de esa desfragmentación (o una ejecución de scandisk antes de la desfragmentación)