Hay una forma muy conveniente de hacer esto disponible desde el Gimp v.2.10:
haga doble clic en la capa que desea mover (o haga clic derecho sobre ella y seleccione "Editar atributos de capa")
aparecerá el cuadro de diálogo "Editar atributos de capa" y allí podrá cambiar los desplazamientos X / Y según sus necesidades
Simplemente así de fácil! :)
EDITAR:
Como @Michael preguntó al respecto en su comentario a mi respuesta, estoy agregando un script que moverá TODAS las capas de imagen en desplazamientos especificados x, y.
Para que funcione, debe crear un archivo en la carpeta de script de Gimp (alguna referencia para esto si lo necesita: 
o 
) con el siguiente contenido:
; This script is free software; you can redistribute it and/or modify
; it under the terms of the GNU General Public License as published by
; the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
; (at your option) any later version.
;
; This script is distributed in the hope that it will be useful,
; but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
; MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
; GNU General Public License for more details.
;; Command is installed in "Layer->Move all layers..."
;;
;; The purpose of this script is to move all image layers by specified x,y offsets
;; X and Y offset parameters must be provided (use integer numbers as values)
;;
(define (dn-move-all-layers orig-image drawable
x-offset y-offset)
(define (get-all-layers img)
(let* (
(all-layers (gimp-image-get-layers img))
(i (car all-layers))
(bottom-to-top ())
)
(set! all-layers (cadr all-layers))
(while (> i 0)
(set! bottom-to-top (append bottom-to-top (cons (aref all-layers (- i 1)) '())))
(set! i (- i 1))
)
bottom-to-top
)
)
(define (move-layer orig-image layer-id offset-x offset-y)
(gimp-layer-set-offsets
layer-id
offset-x
offset-y
)
)
(let* (
(layers nil)
(layerpos 1)
(layer-id "")
(x-os 0)
(y-os 0)
(orig-selection 0)
)
(gimp-image-undo-disable orig-image)
(set! orig-selection (car (gimp-selection-save orig-image)))
(gimp-selection-none orig-image)
(set! x-os x-offset)
(set! y-os y-offset)
(set! layers (get-all-layers orig-image))
(while (pair? layers)
(move-layer orig-image (car layers) x-os y-os)
(set! layers (cdr layers))
(set! layerpos (+ layerpos 1))
)
(gimp-displays-flush)
(gimp-selection-load orig-selection)
(gimp-image-remove-channel orig-image orig-selection)
(gimp-image-undo-enable orig-image)
)
)
(script-fu-register "dn-move-all-layers"
"Move all layers..."
"Move each layer by specified x,y offsets."
"danicotra"
"danicotra"
"08/08/2019"
""
SF-IMAGE "Input image" 0
SF-DRAWABLE "Drawable" 0
SF-VALUE "X offset" "0"
SF-VALUE "Y offset" "0"
)
(script-fu-menu-register "dn-move-all-layers"
"<Image>/Layer/")
Si lo hace correctamente, encontrará un nuevo comando en el menú "Capa" llamado "Mover todas las capas ...", ejecútelo y aparecerá un cuadro de diálogo que le permitirá decidir las compensaciones X e Y. Eso es.
