Arrastre y suelte el archivo que desea ejecutar y no es necesario cambiar el directorio de trabajo.
La forma en que cambio el directorio es yendo de una carpeta a la vez. p.ej:
cd C:
cd Users
cd Name
cd Documents
Luego escriba
pwd
Y mostrará el directorio que ha ingresado.
/cygdrive/c/users/name/documents
También puede copiar y pegar directamente el directorio y simplemente agregar cd
antes de presionar Enter.
Como estoy usando cygwin simple para ejecutar un archivo de procesamiento por lotes de Linux, simplemente arrastro el archivo al terminal y encuentra el directorio y se ejecuta cuando presionas Enter.
/cygdrive/c/Document/.../Dropbox
?