Respuestas:
Si no se especifica la codificación del búfer, EMACS intenta determinarlo automáticamente. Esto causa un problema si el búfer contiene un carácter UTF-8 o Latin1 y se determina que el subproceso está enviando ASCII.
He resuelto el problema colocando esta línea como la primera línea de mi .tex archivos:
% -*-mode: LaTeX; coding: us-ascii;-*-
LC_ALL o LANG Variables de entorno.
Después de buscar y reemplazar, accidentalmente inserté un '-' en una palabra en la lista de LocalWords. Eliminando el guión arreglado el problema