FFmpeg: Eliminar secuencias de subtítulos no compatibles (MKV)

Estoy haciendo un script que recorre una lista de archivos multimedia y luego los vuelve a codificar usando FFmpeg. Mi problema es que necesito eliminar los subtítulos que el contenedor MKV no admite. Esto debería ser simple usando mapeo negativo, sin embargo, el número de secuencia será diferente para cada archivo. Aquí está mi comando actual:

ffmpeg -y -i "path/to/file.ext" -map 0 -c:v libx264 -crf 20 -level 4.1 -profile:v high -c:a copy -q:a 100 -preset faster -strict -2 -movflags faststart -threads 2 -nostdin -stats "file.mkv"

No creo que FFmpeg admita esto de forma nativa. Me las arreglé para escribir una secuencia de comandos que permite ocurrencias únicas o múltiples:

stream_count=$(/usr/bin/ffprobe -select_streams s -show_entries stream=index,codec_name -of csv=p=0 "path/to/file.ext" |& grep -cE 'Subtitle: dvd_subtitle|Subtitle: hdmv_pgs' || :)
if [ "$stream_count" -gt 0 ]
then
    stream_id=$(/usr/bin/ffprobe -select_streams s -show_entries stream=index,codec_name -of csv=p=0 "path/to/file.ext" |& grep -E 'Subtitle: dvd_subtitle|Subtitle: hdmv_pgs' || :)
    if [ "$stream_count" = 1 ]
    then
      exclude_stream=$(echo "$stream_id" | grep -oP '0:[0-9]{1,3}')
      exclude_stream="-map -$exclude_stream"
    else
      counter=0
      until [ "$counter" = "$stream_count" ]
      do
        counter=$((counter+1))
        excluded_stream="$(echo "$stream_id" |& grep -oP '0:[0-9]{1,3}' |& sed -n "${counter}"p)"
        if [ ! -z "$excluded_stream" ]
        then
          if [ "$exclude_stream" = "*$excluded_stream*" ] #If ffprobe returns encode errors within the streams, double results may be returned for the problematic stream which this circumvents
          then
            counter="$stream_count"
          else
            exclude_stream="$exclude_stream -map -$excluded_stream"
          fi
        fi
        excluded_stream=""
      done
    fi
fi
ffmpeg -y -i "path/to/file.ext" -map 0 $exclude -c:v libx264 -crf 20 -level 4.1 -profile:v high -c:a copy -q:a 100 -preset faster -strict -2 -movflags faststart -threads 2 -nostdin -stats "file.mkv" #exclude isn't wrapped as it invalidates the opening hyphen

Si alguien tiene alguna sugerencia para mejorar aún más este script, me encantaría escucharlo.

Gracias @LordNeckbeard por las modificaciones sugeridas al comando ffprobe.