Hasta donde sé, solo puede instalar una versión de IIS en Server 2012, que es IIS 8.
Entiendo que le gustaría usar IIS6, pero no debería haber nada que pueda hacer en IIS 6 que no pueda hacer en IIS 8, con una pequeña configuración. Normalmente, cosas como habilitar el soporte de 32 bits para archivos DLL externos, cambiar la identidad del grupo de aplicaciones, SMTP heredado, soporte FTP heredado, configuraciones ASP, etc. Además, IIS6 no es un gran punto de vista de seguridad.
IIS8 viene con herramientas de administración para IIS6 para configurar aplicaciones heredadas que usan servicios como SMTP.
Puede usar las herramientas de IIS 6 ejecutándose %windir%\system32\inetsrv\InetMgr6.exe
desde un CMD en el núcleo del servidor o Herramientas administrativas - Administrador de Internet Information Services (IIS) 6.0 en Experiencia de escritorio
Para instalar un IIS 8 completo, incluidas todas las funciones, puede usar el siguiente comando.
Install-WindowsFeature -Name Web-Server -IncludeAllSubFeature
Si puede actualizar su pregunta, para incluir qué versión de servidor está ejecutando (Core, Desktop Exp) y el razonamiento por el que necesita IIS6, será más fácil orientarlo en la dirección correcta