Es pedir permiso para comunicarse a través de su firewall.
Windows tiene diferentes políticas de firewall para redes públicas y privadas (las públicas deberían ser más estrictas por razones de seguridad), por lo que básicamente quiere saber si desea permitir que Java se comunique con el mundo exterior , dependiendo de cada tipo de red.
En mi opinión, si no sabes mucho sobre esto, te recomendaría que permitas que Java se comunique tanto en público como en privado, ya que puede ahorrarte problemas en el futuro.