Estos archivos y directorios son creados por varias aplicaciones:
.DS_Store : creado por Finder cuando abre un directorio. Almacena información sobre la carpeta (ver opciones, posiciones de iconos, etc.).
.fseventsd : creado por el demonio fseventsd. Contiene datos sobre eventos del sistema de archivos, tales como modificaciones, eliminación, creación, etc.
.Spotlight-V100 : almacena información de indexación para Spotlight en forma de metadatos.
.Trashes : una carpeta que contiene archivos que se han enviado a la papelera pero que aún no se han eliminado del volumen.
Para evitar que se creen todos, debe modificar el comportamiento de cada aplicación individualmente. Eso incluiría agregar una excepción a Spotlight, deshabilitar la función de almacenamiento en caché del Finder (si es posible), cambiar el demonio fseventsd, etc. No estoy seguro de si es posible agregar exclusiones o deshabilitar todas estas características. Si no necesita escribir en el disco, simplemente lo montaré como de solo lectura para facilitar las cosas.