Componentes de baja varianza en PCA, ¿son realmente solo ruido? ¿Hay alguna forma de probarlo?


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Estoy tratando de decidir si un componente de un PCA se mantendrá o no. Hay una gran cantidad de criterios basados ​​en la magnitud del valor propio, descritos y comparados, por ejemplo, aquí o aquí .

Sin embargo, en mi solicitud sé que el valor propio pequeño (est) será pequeño en comparación con el valor propio grande (st) y todos los criterios basados ​​en la magnitud rechazarán el valor pequeño (est). Esto no es lo que quiero. Lo que me interesa: ¿hay algún método conocido que tenga en cuenta el componente correspondiente real del pequeño valor propio, en el sentido: es realmente "solo" ruido como está implícito en todos los libros de texto, o hay "algo" de potencial? interés dejado? Si es realmente ruido, retírelo; de lo contrario, guárdelo, independientemente de la magnitud del valor propio.

¿Hay algún tipo de prueba de aleatoriedad o distribución establecida para componentes en PCA que no puedo encontrar? ¿O alguien sabe de una razón por la que sería una idea tonta?

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Los histogramas (verde) y las aproximaciones normales (azul) de los componentes en dos casos de uso: una vez probablemente realmente ruido, una vez probablemente no "solo" ruido (sí, los valores son pequeños, pero probablemente no aleatorios). El valor singular más grande es ~ 160 en ambos casos, el más pequeño, es decir, este valor singular, es 0.0xx, demasiado pequeño para cualquiera de los métodos de corte.

Lo que estoy buscando es una forma de formalizar esto ...

probablemente realmente "solo" ruido probablemente no sea ruido pero puede contener partes interesantes


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Muchas de las pruebas a las que se refiere tienen exactamente la propiedad que solicita: intentan distinguir "ruido" de "señal".
whuber

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Recientemente me ha interesado una pregunta similar, pero en una situación específica cuando tiene múltiples mediciones para cada punto de datos. Consulte Elección del número de componentes de PCA cuando hay disponibles varias muestras para cada punto de datos . ¿Quizás también se aplica a su caso?
ameba dice Reinstate Monica

Usar pruebas de distribución en PC para decidir sobre su aleatoriedad suena como una idea muy interesante (que nunca he visto aplicada); Algo similar se hace en ICA, que busca específicamente componentes no gaussianos máximos. ¡Hacer PCA y luego descartar componentes que son "demasiado gaussianos" tiene el sabor de ICA y podría funcionar!
ameba dice Reinstate Monica

Respuestas:


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Una forma de probar la aleatoriedad de un pequeño componente principal (PC) es tratarlo como una señal en lugar de ruido: es decir, tratar de predecir otra variable de interés con él. Esto es esencialmente regresión de componentes principales (PCR) .

R2METROSmi

  • Un modelo de ingeniería química que usa las PC 1, 3, 4, 6, 7 y 8 de un total de 9 ( Smith y Campbell, 1980 )
  • Un modelo de monzón que usa las PC 8, 2 y 10 (en orden de importancia) de 10 ( Kung y Sharif, 1980 )
  • Un modelo económico que usa las PC 4 y 5 de 6 (Hill, Fomby y Johnson, 1977)

Las PC en los ejemplos enumerados anteriormente están numeradas de acuerdo con los tamaños clasificados de sus valores propios. Jolliffe (1982) describe un modelo de nube en el que el último componente contribuye más. Él concluye:

Los ejemplos anteriores han demostrado que no es necesario encontrar datos oscuros o extraños para que los últimos componentes principales sean importantes en la regresión de componentes principales. Más bien parece que tales ejemplos pueden ser bastante comunes en la práctica. Hill y col. (1977) ofrecen una discusión exhaustiva y útil de las estrategias para seleccionar componentes principales que deberían haber ocultado para siempre la idea de la selección basada únicamente en el tamaño de la variación. Desafortunadamente, esto no parece haber sucedido, y la idea está quizás más extendida ahora que hace 20 años.

SS

(pag-1)Y

X

Le debo esta respuesta a @Scortchi, quien corrigió mis propios conceptos erróneos sobre la selección de PC en PCR con algunos comentarios muy útiles, que incluyen: " Jolliffe (2010) revisa otras formas de seleccionar PC". Esta referencia puede ser un buen lugar para buscar más ideas.

Referencias

- Gunst, RF y Mason, RL (1977). Estimación sesgada en regresión: una evaluación que utiliza el error cuadrático medio. Revista de la Asociación Americana de Estadística, 72 (359), 616–628.
- Hadi, AS y Ling, RF (1998). Algunas notas de advertencia sobre el uso de regresión de componentes principales. El estadístico estadounidense, 52 (1), 15-19. Recuperado de http://www.uvm.edu/~rsingle/stat380/F04/possible/Hadi+Ling-AmStat-1998_PCRegression.pdf .
- Hawkins, DM (1973). Sobre la investigación de regresiones alternativas por análisis de componentes principales. Estadísticas aplicadas, 22 (3), 275–286.
- Hill, RC, Fomby, TB y Johnson, SR (1977). Normas de selección de componentes para la regresión de componentes principales.Comunicaciones en estadística: teoría y métodos, 6 (4), 309–334.
- Hotelling, H. (1957). Las relaciones de los nuevos métodos estadísticos multivariados con el análisis factorial. British Journal of Statistical Psychology, 10 (2), 69–79.
- Jackson, E. (1991). Una guía del usuario para los componentes principales . Nueva York: Wiley.
- Jolliffe, IT (1982). Nota sobre el uso de componentes principales en regresión. Estadísticas aplicadas, 31 (3), 300–303. Recuperado de http://automatica.dei.unipd.it/public/Schenato/PSC/2010_2011/gruppo4-Building_termo_identification/IdentificazioneTermodinamica20072008/Biblio/Articoli/PCR%20vecchio%2082.pdf .
- Jolliffe, IT (2010).Análisis de componentes principales (2ª ed.). Saltador.
- Kung, EC y Sharif, TA (1980). Predicción de la regresión del inicio del monzón de verano indio con antecedentes de las condiciones del aire superior. Revista de meteorología aplicada, 19 (4), 370-380. Recuperado de http://iri.columbia.edu/~ousmane/print/Onset/ErnestSharif80_JAS.pdf .
- Lott, WF (1973). El conjunto óptimo de restricciones de componentes principales en una regresión de mínimos cuadrados. Comunicaciones en Estadística - Teoría y Métodos, 2 (5), 449–464.
- Mason, RL y Gunst, RF (1985). Selección de componentes principales en regresión. Estadísticas y cartas de probabilidad, 3 (6), 299–301.
- Massy, ​​WF (1965). Regresión de componentes principales en investigación estadística exploratoria. Revista de la Asociación Americana de Estadística, 60 (309), 234–256. Recuperado de http://automatica.dei.unipd.it/public/Schenato/PSC/2010_2011/gruppo4-Building_termo_identification/IdentificazioneTermodinamica20072008/Biblio/Articoli/PCR%20vecchio%2065.pdf .
- Smith, G. y Campbell, F. (1980). Una crítica de algunos métodos de regresión de crestas. Revista de la Asociación Americana de Estadística, 75 (369), 74-81. Recuperado de https://cowles.econ.yale.edu/P/cp/p04b/p0496.pdf .


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... y no hay garantía alguna de que el efecto que necesita para resolver su problema sea mayor que otros efectos que son simplemente ruido. El problema en cuestión. He visto datos en los que el 95% de la variación era ruido debido a algunos efectos físicos ...
cbeleites admite a Monica

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Muy buena revisión, pero (perdón por discutir de nuevo) ritmo Hadi & Ling, seleccionando las PC para retener en una regresión basada en su fuerte relación con la respuesta, es tan peligroso como seleccionar los predictores originales basados ​​en su fuerte relación con la respuesta. La validación cruzada es esencial y la contracción es preferible. Personalmente, preferiría un uso juicioso de PCA junto con el conocimiento de la materia para guiar la reducción de datos en predictores, ciegos a la respuesta, por ejemplo, usando la primera PC de grupos de predictores que miden casi lo mismo, o determinados por agrupamiento variable.
Scortchi - Restablece a Monica

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+1 (hace mucho tiempo) a esta respuesta, pero después de revisar este hilo ahora, debo decir que esta respuesta casi no responde a la pregunta original: OP estaba preguntando si uno puede usar alguna prueba de distribución en los componentes para juzgar Su aleatoriedad. Vea también mi último comentario al OP.
ameba dice Reinstate Monica

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Agregando a la respuesta de @Nick Stauner, cuando se trata de clustering subespacial, PCA a menudo es una solución pobre.

Cuando se usa PCA, uno se preocupa principalmente por los vectores propios con los valores propios más altos, que representan las direcciones hacia las cuales los datos se 'estiran' más. Si sus datos se componen de pequeños subespacios, PCA los ignorará solemnemente, ya que no contribuyen mucho a la variación general de datos.

Entonces, los vectores propios pequeños no siempre son ruido puro.

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