Respondiendo, a pesar de que esta pregunta es bastante antigua.
La mayor advertencia es que no se puede usar una medición de RR en un estudio de casos y controles, porque no se puede calcular. Si tiene los datos para comparar entre ellos, entonces no hay razón para no hacerlo: las diferencias entre las dos medidas a menudo pueden dar una idea.
Sin embargo, tenga en cuenta que en circunstancias de enfermedades altamente prevalentes (~> 10%), el OR no se aproximará bien al RR. Como lo que la mayoría de los estudios están buscando es un RR o algo que se aproxime en circunstancias especiales (OR, IDR, etc.), si no se puede esperar que el OR se aproxime al RR, sería mejor ir con algo que será.
En términos generales, el OR es una medida de conveniencia para permitir el diseño del estudio de casos y controles, y porque los modelos de regresión binomial a menudo tienen problemas de convergencia.