La respuesta a la pregunta 1 dependerá de su pregunta de investigación y de quién es la audiencia para el resultado.
Si su pregunta de investigación apunta a hablar sobre diferencias en b basadas en el perfil de A, entonces eso obviamente ayudará a enmarcar su resumen. En un estudio epidemiológico, incluso si no está tomando muestras basadas en A (variable independiente como estado expuesto / no expuesto), aún tendría sentido usar esta clasificación como una variable independiente [exposición] y la variable continua como una variable dependiente [resultado ] Parece que ya sabes la respuesta a esto.
También debe considerar cómo podría interpretar el resultado en términos de presentar los resultados a otros (e interpretarlo usted mismo). Un modelo [variable] de variable continua como dependiente tendría una diferencia media (o similar) como un resumen; un modelo dicotómico de variable como resultado tendría una razón de probabilidades (razón de probabilidades aumentadas por una unidad de la variable continua, que podría escalarse para dar, por ejemplo, un aumento relativo por cinco kilos de peso adicional para la probabilidad de diabetes tipo II).
Mi experiencia al consultar los entornos y explicar esto a las personas es que la primera (diferencia de medias) es generalmente más fácil de explicar a otras personas que la segunda (cociente de probabilidad por unidad de diferencia de variable independiente continua).
Para su pregunta 2 , si desea ejecutar un modelo multivariable, en el que controla las covariables, será útil elegir variables dependientes / independientes al comienzo. Probablemente sea mejor seguir con el mismo método, desde análisis univariado hasta multivariable, en lugar de cambiar entre los dos enfoques, solo por la facilidad de la explicación.
Nota final sobre este último punto: desde una perspectiva de prueba de hipótesis, una regresión logística con una variable independiente [exposición] continua y una variable dependiente dicotómica [única] debería devolver el mismo valor p que una prueba t no emparejada suponiendo una varianza desigual con las variables invertido (de memoria, no estoy completamente seguro de si esto siempre es cierto).