¿Ideas para el software de "cuaderno de laboratorio"?


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Así que este es un ajuste extraño, aunque realmente creo que es un ajuste extraño para cualquier sitio, así que pensé en probarlo aquí, entre mis hermanos que analizan datos.

Llegué a la epidemiología y la bioestadística de la biología, y todavía definitivamente tengo algunos hábitos de ese campo. Uno de ellos tiene un cuaderno de laboratorio. Es útil para documentar pensamientos, decisiones, reflexiones sobre el análisis, etc. Todo en un solo lugar, todo comprometido para que pueda revisar el análisis más tarde y tener alguna idea de lo que hice.

Pero sería bueno trasladar eso al siglo XXI. Particularmente porque aunque el sistema de cuaderno de laboratorio es lo suficientemente decente para una persona y documenta las decisiones, sería bueno poder adjuntar tramas de EDA, correos electrónicos de gerentes de datos que discuten un conjunto de datos en particular, etc.

Supongo que esto implicará manipular mi propio sistema a partir de una unión impía de muchos bits diferentes, pero ¿alguien está usando un sistema y tiene alguna recomendación?


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Creo que puede estar bien abuelo (es decir, dejar abierto) este hilo.
gung - Restablece a Monica

Respuestas:


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Estos se llaman Cuadernos de laboratorio electrónicos (ELN).

Estas son algunas de las opciones de código abierto que he visto:

  1. El cuaderno sabio .

  2. El nuevo IPython Notebook , que ahora se puede ejecutar como una aplicación web en EC2 y Azure.

  3. Leo, que se puede usar con IPython y de muchas otras maneras.

  4. Varias soluciones de wiki, blogs y CMS.


Terminé usando un wiki gratuito de Wikispaces como mi sustituto actual del cuaderno experimental de laboratorio.
Fomite

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Mi favorito: Evernote . Puede etiquetar entradas (por ejemplo, 'análisis', 'idea', etc.), puede pegar imágenes y gráficos, y puede compartir cuadernos con colaboradores. Y: es básicamente gratis (bueno, freemium). Pero la edición gratuita es absolutamente suficiente para mí.


Además, hay aplicaciones gratuitas para Android e iOS.
Jose Zubcoff

+1 Creo que la aplicación móvil para Evernote es particularmente útil cuando corro entre laboratorios o anoto un pensamiento cuando está lejos de una computadora.
jthetzel

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Nunca lo he usado personalmente, pero Microsoft tiene una pieza de software en la suite de Office llamada OneNote que cumple un objetivo similar a las especificaciones de su computadora portátil de laboratorio electrónico. Consulte su sitio web para más información. También ofrecen una versión de prueba gratuita incluida con MS Office aquí .


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@mbq ¿ha encontrado un reemplazo decente para Linux para Onenote?
andreas-h

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Encontré Xmind útil. Puede adjuntar cualquier cosa, y la estructura de árbol es realmente útil para organizar. Me gusta especialmente la función en la que puede profundizar en el nodo (tema). Hay productos de software más similares que explotan el mismo concepto.


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Freeplane y Freemind son dos alternativas gratuitas que he usado para varios proyectos. Una nueva bifurcación de FreeMind es SciPlore MindMappings, que incluye soporte para referencias BibTeX e importación de marcadores desde un PDF.
Wayne

2

Personalmente he encontrado el Livescribe 'bolígrafo inteligente' un Dios enviar.

combina el fiel "encanto del viejo mundo" de un cuaderno de lápiz y papel tradicional, pero incluye la capacidad de grabar sonido (que se sincroniza con los trazos del lápiz) listo para su posterior revisión. NB: hay un inconveniente y es que tienes que comprar papel especial que funcione con el bolígrafo ..... columpios y vueltas realmente

El audio / bolígrafo se carga en la web y luego se conecta a muchos de los otros programas ya mencionados anteriormente.

A los estudiantes a los que enseño (biomecánica) les encanta esto y luego el estudio de conceptos difíciles es mucho más fácil que antes (pre-suscripción)


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Es posible que desee consultar la última versión beta de Zotero , que ahora es independiente y no requiere Firefox.


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Zotero es un administrador de bibliografía, no un ELN.
nico

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@nico: Creo que puedes almacenar lo que quieras en Zotero, incluidos tus propios documentos. No es exactamente un ELN, pero es gratuito y facilitaría también incluir (e indexar) otros materiales.
Wayne

claro, y es genial que lo hayas mencionado (lo uso mucho y es sorprendente), pero existen otras alternativas de código abierto que se consideran específicamente como ELN, entonces, ¿por qué no usarlas?
nico

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Consulte este artículo, Embellecimiento de datos en el mundo real , de Nature Precedings para algunas ideas.


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es un buen artículo, pero sería útil resumir parte de la información en su respuesta
Abe

Hola @Abe, sí, eso sería más útil. No he leído el artículo yo mismo, lo encontré ayer y no estoy especialmente interesado en el tema. Pensé que compartiría de todos modos.
Charlie

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¿Qué tal un Boogie Board? Puede escribir sus notas en una pizarra y grabarlas como la misma idea que el bolígrafo LiveScribe, pero puede guardarlas como archivos PDF ... Todavía no está disponible, pero estará en menos de un mes.


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NomanJaved
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