¿Existe un paquete R (o incluso una función R base) que implemente el método de Fisher o Stouffer para combinar valores p? Codificar esto debería ser casi trivial, pero prefiero usar (y citar) un paquete.
Código de ejemplo en esta pregunta: Método de Fisher para peinar los valores p: ¿qué pasa con la cola inferior?
Respuestas:
El metappaquete de Michael Dewey implementa muchos métodos para combinar valores p:
sumlog: Método de Fishersumz: Parece el método de Stouffer (con pesos), esto no se menciona explícitamente en la documentación de la función pero se confirma en el borrador de la viñeta (que aún no forma parte del paquete)meanp: Al combinar valores p, ¿por qué no solo promediar?También existe la combine.testfunción en el survcomppaquete (en Bioconductor). Implementa el método de Fisher y Stouffer, así como el método logit.
survcomptambién funciona en el caso límite de un solo valor, maneja los valores faltantes de manera más consistente con la base r y alienta las contribuciones al proporcionar un repositorio oficial.