Estoy tratando de entender cómo funciona dinterval () en JAGS para datos censurados. Estoy modelando datos gruesos donde solo tengo límites superiores e inferiores para cada punto de datos (no el valor verdadero). Aquí hay un ejemplo simple de cómo creo que debería funcionar:
Algunos límites superior e inferior para cada punto:
> head(lim)
L U
[1,] 14.98266 15.68029
[2,] 21.21827 21.91590
[3,] 18.34953 19.04716
[4,] 19.00186 19.69949
[5,] 15.39891 16.09654
[6,] 17.81705 18.51468
Una función para escribir el modelo (suponiendo que los datos provienen de una normal con una media y varianza común):
playmodel <- function(){
for (i in 1:50){
is.censored[i] ~ dinterval(t[i], lim[i,])
t[i] ~ dnorm(mu,tau)
}
mu ~ dnorm(0,.001)
tau ~ dgamma(.01,.01)
}
filename <- "toymod.bug"
write.model(toymod,filename)
Algunas funciones y asignaciones para la llamada jags:
data <- list("lim"=lim)
inits <- list(mu=rnorm(1),tau=rgamma(1,.01,.01),t=as.vector(apply(lim,1,mean)))
#last part is to ensure the starting value is between the upper and lower limit
#each chain will start at the same place for t but this is just for this case
params <- c("mu","tau")
Y ejecuta el modelo:
playmodel.jags <- jags(data,inits, params, model.file="toymod.bug", n.chains=3,
n.iter=50000,n.burnin=30000, n.thin=1, DIC=TRUE,
working.directory=NULL,refresh = 50000/50, progress.bar = "text")
¿Qué sucede cuando ejecuto esto?
1) mi estimación de mu ronda alrededor de 0 cuando debería ser 15
2) no se ejecutará si DIC = TRUE:
error: "Error en jags.samples (modelo, variables.nombres, n.iter, thin, type =" trace ",: Error al establecer el monitor de seguimiento para la desviación del nodo
Nota: Puedo obtener un modelo similar ejecutándose en OpenBUGS omitiendo la línea dinterval () y agregando I (Lower, Upper) a dnorm.