Distribuciones sesgadas para la regresión logística


8

He estado desarrollando un modelo de regresión logística basado en datos retrospectivos de una base de datos nacional de traumatismos de lesiones en la cabeza en el Reino Unido. El resultado clave es la mortalidad a los 30 días (indicada como Outcome30medida). Otras medidas en toda la base de datos con evidencia publicada de un efecto significativo sobre el resultado en estudios anteriores incluyen:

Yeardecimal - Date of procedure = 1994.0-2013.99
inctoCran - Time from head injury to craniotomy in minutes = 0-2880 (After 2880 minutes is defined as a separate diagnosis)
ISS - Injury Severity Score = 1-75
Age - Age of patient = 16.0-101.5
GCS - Glasgow Coma Scale = 3-15
Sex - Gender of patient = Male or Female
rcteyemi - Pupil reactivity (1 = neither, 2 = one, 3 = both)
neuroFirst2 - Location of admission (Neurosurgical unit or not)
Other - other traums (0 - No, 1 - Yes)
othopYN - Other operation required
LOS - Length of stay in days
LOSCC - Length of stay in critical care in days 

Cuando realizo un análisis univariado de las variables, he realizado una regresión logística para cada variable continua. Sin embargo, no puedo modelar Yeardecimal con el siguiente resultado:

> rcs.ASDH<-lrm(formula = Survive ~ Yeardecimal, data = ASDH_Paper1.1)
singular information matrix in lrm.fit (rank= 1 ).  Offending variable(s):
Yeardecimal 
Error in lrm(formula = Survive ~ Yeardecimal, data = ASDH_Paper1.1) : 
  Unable to fit model using lrm.fit

Sin embargo, la spline cúbica restringida funciona:

> rcs.ASDH<-lrm(formula = Survive ~ rcs(Yeardecimal), data = ASDH_Paper1.1)
> 
> rcs.ASDH

Logistic Regression Model

lrm(formula = Survive ~ rcs(Yeardecimal), data = ASDH_Paper1.1)

                      Model Likelihood     Discrimination    Rank Discrim.    
                         Ratio Test            Indexes          Indexes       
Obs          5998    LR chi2     106.61    R2       0.027    C       0.578    
 0           1281    d.f.             4    g        0.319    Dxy     0.155    
 1           4717    Pr(> chi2) <0.0001    gr       1.376    gamma   0.160    
max |deriv| 2e-08                          gp       0.057    tau-a   0.052    
                                           Brier    0.165                     

               Coef     S.E.    Wald Z Pr(>|Z|)
Intercept      -68.3035 45.8473 -1.49  0.1363  
Yeardecimal      0.0345  0.0229  1.51  0.1321  
Yeardecimal'     0.1071  0.0482  2.22  0.0262  
Yeardecimal''   -2.0008  0.6340 -3.16  0.0016  
Yeardecimal'''  11.3582  4.0002  2.84  0.0045  

¿Alguien podría explicar por qué es esto? Estoy nervioso por usar un modelo de modo complicado si no puedo modelar con un enfoque más simple.

Actualmente estoy usando splines cúbicos restringidos para modelar Age, ISS y Yeardecimal. ¿Alguien recomendaría algún enfoque alternativo?


44
Se requiere no, pero puede ser sensato transformar algunos de los predictores más sesgados antes de crear la base de spline, para evitar tener algún punto de datos con un apalancamiento muy alto.
Scortchi - Restablece a Monica

Para ver si la respuesta de @ StasK es correcta, considere probar esto con la glmfunción de vainilla , según r.789695.n4.nabble.com/…
shadowtalker

Respuestas:


7

La fecha como predictor puede estar fallando porque es altamente colineal con la constante. Si lo ingresa como un año, su variabilidad es aproximadamente 10/2000 = 0.005 (de hecho menos porque la mayoría de sus datos están en los años más recientes), y cuando se ajusta al cuadrado se convierte en 4e-6. Al invertir una matriz con valores propios 1 y 4e-6, el paquete que utilice puede decidir que es cero en aritmética de precisión finita y arrojar este mensaje de error. La solución es simple: centre sus datos, al menos aproximadamente, restando 2000 del año.


1
Esto resolvió el problema, gracias por la explicación.
Fuente de Dan

No veo eso Esa es una muy buena variedad de fechas.
Frank Harrell

5

Se esperaría que las splines cúbicas restringidas funcionen bien aquí. Le preocupan demasiado las distribuciones marginales de predictores.

La duración de la estadía se encuentra en la parte incorrecta de la vía causal para usarla como predictor de muerte. Y cuidado con otras operaciones requeridas.

No veo mucho valor en los análisis univariables.


Gracias. Estoy de acuerdo, pero en la literatura se piden resultados tradicionalmente univariados. ¿Alguna idea de por qué la regresión logística está ejecutando un error para Yeardecimal cuando un término lineal?
Fuente de Dan

55
Frank Harrell es la literatura .
StasK

2
Disculpas, me refería a estudios de resultados en hematoma subdural.
Fuente de Dan
Al usar nuestro sitio, usted reconoce que ha leído y comprende nuestra Política de Cookies y Política de Privacidad.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.