Verifique el estado del proceso de capacitación en R [cerrado]


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Estoy entrenando un modelo usando el caretpaquete en R durante casi 3 días. Los cálculos se ejecutan en paralelo (múltiples procesos). Desafortunadamente, no hay salida en la consola R (modelo SVM del kernlabpaquete), así que no sé si he terminado con el 10% o el 90%.

¿Hay alguna manera de averiguar de alguna manera cuál es el proceso de los cálculos?

Estoy usando OS X, así que tal vez descarte la pila de procesos e intente encontrar los valores de los parámetros que se están evaluando actualmente o la iteración de k-fold. ¿Pero cómo?

EDITAR: el guión para la formación:

ctrl <- trainControl(method = "cv", number = 10, selectionFunction = "best", 
                     classProbs = TRUE, summaryFunction =  twoClassSummary,
                     verboseIter = TRUE)

grid_svm <- expand.grid(.C = logseq(2^-15, 2^3, 10))

svm <- train(CLASS ~ ., data = dataset, method = "svmLinear", preProcess = c("center", "scale"),
            metric = "ROC", trControl = ctrl, tuneGrid = grid_svm, verbose = TRUE)

Respuestas:


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Cuando se usa caretpara entrenamiento, puede configurar la opción verbose = TRUEdentro de la trainfunción. Para más detalles, también existe el verboseIterargumento dentro de la trainControlllamada. Max Kuhn tiene un excelente sitio web creado a partir de la página de Github que puede ayudarlo a familiarizarse más con las funciones aquí .


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Gracias por responder. Conozco esas opciones, pero no parecen funcionar para el procesamiento paralelo. He actualizado mi publicación con un fragmento del código utilizado.
— Khozzy

Ah, eso no estaba claro ( allowParallelsin embargo, su fragmento omite el argumento). A partir de ahora, no conozco ninguna funcionalidad dentro de caret para proporcionar una salida detallada paralela. Esto se debe a que los foreachbucles se han verbosecodificado como FALSE. Si esto es importante para usted, su mejor opción puede ser enviar un problema en la página de github y ver si se puede implementar un cambio.
— cdeterman

Siguiendo su recomendación, he creado un problema en Github. Creo que es una funcionalidad bastante deseada.
— Khozzy

Bien, como cortesía si se crea la funcionalidad, sería genial si pudiera volver a publicar aquí con la respuesta para que otros puedan ver cómo funciona la solución.
— cdeterman

2
Puede modificar la fitfunción para imprimir más. Si no está viendo ningún registro y lo ha hecho verboseIter = TRUE, ¿está utilizando RStudio? RStudio desvía la salida de manera diferente que R; Recibo registros en la base R pero no en RStudio. También hay topunix para que pueda verificar que no haya agotado la memoria del sistema (necesita más para ejecutarse en paralelo) y que los trabajadores estén activos.
— topepo
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