¿Qué preguntas haría un estadístico sobre el análisis del brote de E. coli?


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Es posible que haya escuchado sobre el reciente brote de E. coli enterohemorrágica ( EHEC ) en Alemania .
¿Qué preguntas haría un estadístico sobre el análisis EHEC?
Estoy pensando en Q +. Entre reporteros / funcionarios públicos experts no expertos, dicen profesores e ingenieros con un diploma / maestría pero a lo sumo un puñado de estadísticas.

(¿Es posible una imagen, un mapa de la tierra de EHEC que muestre varias cepas de EHEC y la cobertura de varias pruebas?)

Lunes 20 de junio: pensé que el brote de EHEC sería un área donde las estadísticas realmente son importantes en el mundo en general: ¿cuál es la evidencia de varias causas, cómo se pueden comunicar al público? Entonces, comenzando una recompensa.


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No estoy seguro de si debería ser una wiki comunitaria, ya que creo que los votos sobre buenas respuestas deberían contar para el representante, y existe la posibilidad de que obtenga mejores respuestas si ese es el caso.
Jeromy Anglim

Respuestas:


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f(s)=E(prevalence| you are in location s). Para que no sobreajuste los datos, sería apropiado un poco de suavizado, que efectivamente "uniría" ubicaciones cercanas juntas. El enfoque más simple sería usar una función de estimación de densidad del núcleo (por ejemplo, la función kde2d en R, aunque puede ser necesario un cierto procesamiento previo de los datos). Esto ayudaría a identificar "puntos calientes" en la distribución espacial y podría llevar a un investigador a identificar reservorios ambientales de E. Coli.

Dependiendo de qué otros datos tenga, podrían usarse modelos espaciales más sofisticados que se ajustan a los factores de confusión conocidos.


El diagnóstico de las variantes de EHEC y sus posibles fuentes parece difícil, aunque dudoso. Como saben, los funcionarios alemanes primero dijeron "son pepinos de España", y luego semanas "definitivamente brotan" (¿semillas, agua ...?) (Me doy cuenta de que muchas personas quieren una respuesta instantánea y se les sirve una). síntomas claros, un mapa puede conducir a una causa, como en el famoso mapa del brote de cólera en Londres en 1854 . ¿Pero el mapa de brotes de EHEC ?
denis
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