"Bayesiano" y "frecuentista" no son "filosofías probabilísticas". Son escuelas de pensamiento y práctica estadística que se preocupan principalmente por cuantificar la incertidumbre y tomar decisiones, aunque a menudo se asocian con interpretaciones particulares de probabilidad. Probablemente, la percepción más común, aunque es incompleta, es la de la probabilidad como cuantificación subjetiva de la creencia frente a las probabilidades como frecuencias de largo plazo. Pero incluso estos no son realmente mutuamente excluyentes. Y es posible que no se dé cuenta de esto, pero hay Bayesianos declarados que no están de acuerdo en cuestiones filosóficas particulares sobre la probabilidad.
Las estadísticas bayesianas y las frecuentes no son ortogonales tampoco. Parece que "frecuenta" ha llegado a significar "no bayesiano", pero eso es incorrecto. Por ejemplo, es perfectamente razonable hacer preguntas sobre las propiedades de los estimadores bayesianos y los intervalos de confianza bajo muestreo repetido. Es una falsa dicotomía perpetuada, al menos en parte, por la falta de una definición común de los términos bayesiano y frecuentista (los estadísticos no tenemos a nadie a quien culpar sino a nosotros mismos por eso).
Para una discusión divertida, puntiaguda y reflexiva, sugeriría las "Objeciones a las estadísticas bayesianas" de Gelman, los comentarios y la réplica, disponibles aquí:
http://ba.stat.cmu.edu/vol03is03.php
Incluso hay algunas discusiones sobre intervalos de confianza en física IIRC. Para discusiones más profundas, puede repasar las referencias allí. Si desea comprender los principios detrás de la inferencia bayesiana, sugeriría el libro de Bernando & Smith, pero hay muchas, muchas otras buenas referencias.