La mejor manera de interactuar con una sesión R que se ejecuta en la nube

Tengo R ejecutándose en Amazon EC2, usando una versión modificada del bioconductor AMI . Actualmente, estoy usando putty para ssh en mi servidor, comenzando R desde la línea de comando y luego copiando y pegando mi script desde notepad ++ en mi sesión de putty.

La cosa es que odio cortar y pegar. Se siente como una edad de piedra y ocasionalmente tengo problemas extraños de almacenamiento en búfer que arruinan mi código. No puedo usar RStudio , ya que no es compatible con multinúcleo , del cual dependo en gran medida.

¿Cuál es la forma más elegante de hacer esto?

/ Editar: Gracias por todas las excelentes sugerencias. Por ahora, he cambiado a usar foreach con el backend doRedis, que funciona muy bien en mi Mac, mi PC y en Amazon a través de RStudio. Este cambio fue bastante fácil una vez que aprendí a escribir una función que emula "lapply" usando "foreach". (¡Además, doRedis es increíble!)

Se me ocurren algunas maneras. He hecho esto bastante y estas son las formas que me parecieron más útiles:

1. Modo Emacs Daemon . ssh en la instancia EC2 con el interruptor -X para que reenvíe X windows a su máquina de eliminación. El uso del modo demonio asegurará que no pierdas el estado si tu conexión se agota o se cae
2. En lugar de usar el paquete multinúcleo, use un backend paralelo diferente con el paquete foreach. De esa manera puedes usar RStudio, lo cual es fantástico. Foreach es genial porque puedes probar tu código en un modo no paralelo, luego cambiar al modo paralelo simplemente cambiando tu backend (1 o 2 líneas de código). Recomiendo el backend doRedis. Estás en la nube, ¡también podrías encender varias máquinas!

La forma más conveniente es simplemente instalar el servidor VNC y un entorno ligero como XFCE y crear una sesión virtual que pueda usar desde donde quiera (persiste las desconexiones), es decir, algo como esto:

Otros beneficios adicionales son que puede usar su portapapeles local en el escritorio virtual y ver las gráficas R mucho más rápido que mediante el reenvío X11 o la copia de archivos de imagen.

Se necesita un poco de esfuerzo para configurar todo correctamente (X init, túnel ssh), pero Internet está lleno de tutoriales sobre cómo hacerlo.

No sé cómo funciona Amazon EC2, así que quizás mis soluciones simples no funcionen. Pero normalmente uso scp o sftp (a través de WinSCP si estoy en Windows) o git.

Usaría rsync para enviar los scripts y los archivos de datos al servidor, luego "nohup Rscript myscript.R> output.out &" para ejecutar las cosas y cuando termine, rsync para obtener los resultados.

VIM + tmux + VIM Slime. Obtiene el mejor editor de texto y la capacidad de enviar código del editor a la línea de comando R (al igual que en Rstudio).

Uso R Studio en EC2 todo el tiempo gracias a los AMI creados por Louis Aslett . No tiene que saber nada de SSH ni nada (aparte de R, por supuesto). Solo necesita una cuenta EC2. Como se menciona en una de las otras respuestas, R Studio admite computación paralela, por ejemplo , a través del paquete foreach . Esto realmente permite aprovechar el poder de EC2. Al usar una instancia de cómputo optimizado (32 núcleos), pude reducir significativamente el tiempo de entrenamiento para mis modelos ML casi sin costo (unos pocos dólares por hora).