Si bien Bison tiene licencia bajo la GPL, un analizador creado por Bison no está cubierto automáticamente por la GPL, al menos no con versiones recientes de Bison:
Condiciones para usar Bison
Los términos de distribución para los analizadores generados por Bison permiten utilizar los analizadores en programas no libres. Antes de la versión 2.2 de Bison, estos permisos adicionales se aplicaban solo cuando Bison generaba analizadores LALR (1) en C. Y antes de la versión 1.24 de Bison, los analizadores generados por Bison solo podían usarse en programas que eran software libre.
Fuente: http://www.gnu.org/software/bison/manual/bison.html#Conditions
Sin embargo, un analizador creado a partir de una gramática con licencia GPL probablemente también esté cubierto por la GPL, porque es un "trabajo basado en" la gramática (es una conversión automática, como compilar un programa).
Por supuesto, como en todos los asuntos legales, no hay una respuesta definitiva, e incluso los abogados y jueces pueden estar en desacuerdo, pero creo que este es el consenso general.