Parece que esto se trata específicamente de definir una consulta grande dentro de un lenguaje de programación, ver que colocas la consulta dentro de un literal de cadena y la concatenas.
Si se trata de un lenguaje compilado, no debería haber ninguna diferencia: una de las primeras optimizaciones que haría el compilador es concatenar automáticamente los literales de las cadenas, de modo que termines con una cadena grande de todos modos.
En cuanto a la sintaxis, debería considerar mover la consulta fuera de su código: almacénela en un archivo de recursos .sql separado y haga que su software lea ese archivo. Utilice declaraciones preparadas para las variables, si no se trata de una consulta que se construye dinámicamente (es decir, cláusulas where, etc., agregadas según ciertos parámetros). Si se construye dinámicamente, puede agregar variables de reemplazo propias, insertando parámetros adicionales donde y cuando sea necesario.
En cuanto a las 1600 columnas, recomiendo seriamente construir una vista para eso, así que en lugar de
SELECT column1, column2, .... column1600 from X where Y
obtendrías
SELECCIONE * DESDE viewX DONDE y
Mucho más conciso en su propio código.
.
), que he visto que algunos programadores culpan por los costos de rendimiento.