Recientemente notamos que nuestras consultas a la base de datos han tardado mucho más de lo habitual en ejecutarse. Después de un poco de investigación, parece que estamos obteniendo lecturas de disco muy lentas.
En el pasado, nos encontramos con un problema similar causado por el controlador RAID que inicia un ciclo de reaprendizaje en la BBU y cambia a escritura. No parece que este sea el caso esta vez.
Corrí bonnie++algunas veces en el transcurso de un par de días. Aquí están los resultados:
Las lecturas de 22-82 M / s parecen bastante abismales. Ejecutar ddel dispositivo sin procesar durante unos minutos muestra entre 15.8 MB / sy 225 MB / s de lecturas (consulte la actualización a continuación). iotopno indica ningún otro proceso que compita por IO, por lo que no estoy seguro de por qué la velocidad de lectura es tan variable.
La tarjeta RAID es una MegaRAID SAS 9280 con 12 unidades SAS (15k, 300GB) en RAID10 con un sistema de archivos XFS (SO en dos SSD configurados en RAID1). No veo ninguna alerta SMART y la matriz no parece estar degradada.
También he corrido xfs_checky no parece haber ningún problema de consistencia XFS.
¿Cuáles deberían ser los próximos pasos de investigación aquí?
Especificaciones del servidor
Ubuntu 12.04.5 LTS
128GB RAM
Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2643 0 @ 3.30GHz
Salida de xfs_repair -n:
Phase 1 - find and verify superblock...
Phase 2 - using internal log
- scan filesystem freespace and inode maps...
- found root inode chunk
Phase 3 - for each AG...
- scan (but don't clear) agi unlinked lists...
- process known inodes and perform inode discovery...
- agno = 0
- agno = 1
- agno = 2
- agno = 3
- process newly discovered inodes...
Phase 4 - check for duplicate blocks...
- setting up duplicate extent list...
- check for inodes claiming duplicate blocks...
- agno = 1
- agno = 3
- agno = 2
- agno = 0
No modify flag set, skipping phase 5
Phase 6 - check inode connectivity...
- traversing filesystem ...
- traversal finished ...
- moving disconnected inodes to lost+found ...
Phase 7 - verify link counts...
No modify flag set, skipping filesystem flush and exiting.
Salida de megacli -AdpAllInfo -aAll:
Versions
================
Product Name : LSI MegaRAID SAS 9280-4i4e
Serial No : SV24919344
FW Package Build: 12.12.0-0124
Mfg. Data
================
Mfg. Date : 12/06/12
Rework Date : 00/00/00
Revision No : 04B
Battery FRU : N/A
Image Versions in Flash:
================
FW Version : 2.130.363-1846
BIOS Version : 3.25.00_4.12.05.00_0x05180000
Preboot CLI Version: 04.04-020:#%00009
WebBIOS Version : 6.0-51-e_47-Rel
NVDATA Version : 2.09.03-0039
Boot Block Version : 2.02.00.00-0000
BOOT Version : 09.250.01.219
Pending Images in Flash
================
None
PCI Info
================
Controller Id : 0000
Vendor Id : 1000
Device Id : 0079
SubVendorId : 1000
SubDeviceId : 9282
Host Interface : PCIE
ChipRevision : B4
Link Speed : 0
Number of Frontend Port: 0
Device Interface : PCIE
Number of Backend Port: 8
Port : Address
0 5003048001c1e47f
1 0000000000000000
2 0000000000000000
3 0000000000000000
4 0000000000000000
5 0000000000000000
6 0000000000000000
7 0000000000000000
HW Configuration
================
SAS Address : 500605b005a6cbc0
BBU : Present
Alarm : Present
NVRAM : Present
Serial Debugger : Present
Memory : Present
Flash : Present
Memory Size : 512MB
TPM : Absent
On board Expander: Absent
Upgrade Key : Absent
Temperature sensor for ROC : Absent
Temperature sensor for controller : Absent
Settings
================
Current Time : 14:58:51 7/11, 2016
Predictive Fail Poll Interval : 300sec
Interrupt Throttle Active Count : 16
Interrupt Throttle Completion : 50us
Rebuild Rate : 30%
PR Rate : 30%
BGI Rate : 30%
Check Consistency Rate : 30%
Reconstruction Rate : 30%
Cache Flush Interval : 4s
Max Drives to Spinup at One Time : 4
Delay Among Spinup Groups : 2s
Physical Drive Coercion Mode : Disabled
Cluster Mode : Disabled
Alarm : Enabled
Auto Rebuild : Enabled
Battery Warning : Enabled
Ecc Bucket Size : 15
Ecc Bucket Leak Rate : 1440 Minutes
Restore HotSpare on Insertion : Disabled
Expose Enclosure Devices : Enabled
Maintain PD Fail History : Enabled
Host Request Reordering : Enabled
Auto Detect BackPlane Enabled : SGPIO/i2c SEP
Load Balance Mode : Auto
Use FDE Only : No
Security Key Assigned : No
Security Key Failed : No
Security Key Not Backedup : No
Default LD PowerSave Policy : Controller Defined
Maximum number of direct attached drives to spin up in 1 min : 120
Auto Enhanced Import : No
Any Offline VD Cache Preserved : No
Allow Boot with Preserved Cache : No
Disable Online Controller Reset : No
PFK in NVRAM : No
Use disk activity for locate : No
POST delay : 90 seconds
BIOS Error Handling : Stop On Errors
Current Boot Mode :Normal
Capabilities
================
RAID Level Supported : RAID0, RAID1, RAID5, RAID6, RAID00, RAID10, RAID50, RAID60, PRL 11, PRL 11 with spanning, SRL 3 supported, PRL11-RLQ0 DDF layout with no span, PRL11-RLQ0 DDF layout with span
Supported Drives : SAS, SATA
Allowed Mixing:
Mix in Enclosure Allowed
Mix of SAS/SATA of HDD type in VD Allowed
Status
================
ECC Bucket Count : 0
Limitations
================
Max Arms Per VD : 32
Max Spans Per VD : 8
Max Arrays : 128
Max Number of VDs : 64
Max Parallel Commands : 1008
Max SGE Count : 80
Max Data Transfer Size : 8192 sectors
Max Strips PerIO : 42
Max LD per array : 16
Min Strip Size : 8 KB
Max Strip Size : 1.0 MB
Max Configurable CacheCade Size: 0 GB
Current Size of CacheCade : 0 GB
Current Size of FW Cache : 350 MB
Device Present
================
Virtual Drives : 2
Degraded : 0
Offline : 0
Physical Devices : 16
Disks : 14
Critical Disks : 0
Failed Disks : 0
Supported Adapter Operations
================
Rebuild Rate : Yes
CC Rate : Yes
BGI Rate : Yes
Reconstruct Rate : Yes
Patrol Read Rate : Yes
Alarm Control : Yes
Cluster Support : No
BBU : Yes
Spanning : Yes
Dedicated Hot Spare : Yes
Revertible Hot Spares : Yes
Foreign Config Import : Yes
Self Diagnostic : Yes
Allow Mixed Redundancy on Array : No
Global Hot Spares : Yes
Deny SCSI Passthrough : No
Deny SMP Passthrough : No
Deny STP Passthrough : No
Support Security : No
Snapshot Enabled : No
Support the OCE without adding drives : Yes
Support PFK : Yes
Support PI : No
Support Boot Time PFK Change : No
Disable Online PFK Change : No
PFK TrailTime Remaining : 0 days 0 hours
Support Shield State : No
Block SSD Write Disk Cache Change: No
Supported VD Operations
================
Read Policy : Yes
Write Policy : Yes
IO Policy : Yes
Access Policy : Yes
Disk Cache Policy : Yes
Reconstruction : Yes
Deny Locate : No
Deny CC : No
Allow Ctrl Encryption: No
Enable LDBBM : No
Support Breakmirror : No
Power Savings : No
Supported PD Operations
================
Force Online : Yes
Force Offline : Yes
Force Rebuild : Yes
Deny Force Failed : No
Deny Force Good/Bad : No
Deny Missing Replace : No
Deny Clear : No
Deny Locate : No
Support Temperature : Yes
NCQ : No
Disable Copyback : No
Enable JBOD : No
Enable Copyback on SMART : No
Enable Copyback to SSD on SMART Error : Yes
Enable SSD Patrol Read : No
PR Correct Unconfigured Areas : Yes
Enable Spin Down of UnConfigured Drives : Yes
Disable Spin Down of hot spares : No
Spin Down time : 30
T10 Power State : No
Error Counters
================
Memory Correctable Errors : 0
Memory Uncorrectable Errors : 0
Cluster Information
================
Cluster Permitted : No
Cluster Active : No
Default Settings
================
Phy Polarity : 0
Phy PolaritySplit : 0
Background Rate : 30
Strip Size : 256kB
Flush Time : 4 seconds
Write Policy : WB
Read Policy : Adaptive
Cache When BBU Bad : Disabled
Cached IO : No
SMART Mode : Mode 6
Alarm Disable : Yes
Coercion Mode : None
ZCR Config : Unknown
Dirty LED Shows Drive Activity : No
BIOS Continue on Error : 0
Spin Down Mode : None
Allowed Device Type : SAS/SATA Mix
Allow Mix in Enclosure : Yes
Allow HDD SAS/SATA Mix in VD : Yes
Allow SSD SAS/SATA Mix in VD : No
Allow HDD/SSD Mix in VD : No
Allow SATA in Cluster : No
Max Chained Enclosures : 16
Disable Ctrl-R : Yes
Enable Web BIOS : Yes
Direct PD Mapping : No
BIOS Enumerate VDs : Yes
Restore Hot Spare on Insertion : No
Expose Enclosure Devices : Yes
Maintain PD Fail History : Yes
Disable Puncturing : No
Zero Based Enclosure Enumeration : No
PreBoot CLI Enabled : Yes
LED Show Drive Activity : Yes
Cluster Disable : Yes
SAS Disable : No
Auto Detect BackPlane Enable : SGPIO/i2c SEP
Use FDE Only : No
Enable Led Header : No
Delay during POST : 0
EnableCrashDump : No
Disable Online Controller Reset : No
EnableLDBBM : No
Un-Certified Hard Disk Drives : Allow
Treat Single span R1E as R10 : No
Max LD per array : 16
Power Saving option : Don't Auto spin down Configured Drives
Max power savings option is not allowed for LDs. Only T10 power conditions are to be used.
Default spin down time in minutes: 30
Enable JBOD : No
TTY Log In Flash : No
Auto Enhanced Import : No
BreakMirror RAID Support : No
Disable Join Mirror : No
Enable Shield State : No
Time taken to detect CME : 60s
Salida de megacli -AdpBbuCmd -GetBbuSTatus -aAll:
BBU status for Adapter: 0
BatteryType: iBBU
Voltage: 4068 mV
Current: 0 mA
Temperature: 30 C
Battery State: Optimal
BBU Firmware Status:
Charging Status : Charging
Voltage : OK
Temperature : OK
Learn Cycle Requested : No
Learn Cycle Active : No
Learn Cycle Status : OK
Learn Cycle Timeout : No
I2c Errors Detected : No
Battery Pack Missing : No
Battery Replacement required : No
Remaining Capacity Low : No
Periodic Learn Required : No
Transparent Learn : No
No space to cache offload : No
Pack is about to fail & should be replaced : No
Cache Offload premium feature required : No
Module microcode update required : No
GasGuageStatus:
Fully Discharged : No
Fully Charged : No
Discharging : Yes
Initialized : Yes
Remaining Time Alarm : No
Discharge Terminated : No
Over Temperature : No
Charging Terminated : No
Over Charged : No
Relative State of Charge: 88 %
Charger System State: 49169
Charger System Ctrl: 0
Charging current: 512 mA
Absolute state of charge: 87 %
Max Error: 4 %
Exit Code: 0x00
Salida de megacli -LDInfo -Lall -aAll:
Adapter 0 -- Virtual Drive Information:
Virtual Drive: 0 (Target Id: 0)
Name :
RAID Level : Primary-1, Secondary-0, RAID Level Qualifier-0
Size : 111.281 GB
Sector Size : 512
Mirror Data : 111.281 GB
State : Optimal
Strip Size : 256 KB
Number Of Drives : 2
Span Depth : 1
Default Cache Policy: WriteBack, ReadAhead, Direct, No Write Cache if Bad BBU
Current Cache Policy: WriteBack, ReadAhead, Direct, No Write Cache if Bad BBU
Default Access Policy: Read/Write
Current Access Policy: Read/Write
Disk Cache Policy : Disk's Default
Encryption Type : None
Is VD Cached: No
Virtual Drive: 1 (Target Id: 1)
Name :
RAID Level : Primary-1, Secondary-0, RAID Level Qualifier-0
Size : 1.633 TB
Sector Size : 512
Mirror Data : 1.633 TB
State : Optimal
Strip Size : 256 KB
Number Of Drives per span:2
Span Depth : 6
Default Cache Policy: WriteBack, ReadAhead, Direct, Write Cache OK if Bad BBU
Current Cache Policy: WriteBack, ReadAhead, Direct, Write Cache OK if Bad BBU
Default Access Policy: Read/Write
Current Access Policy: Read/Write
Disk Cache Policy : Disk's Default
Encryption Type : None
Is VD Cached: No
Actualización: Según el consejo de Andrew, corrí dddurante unos minutos para ver qué tipo de rendimiento obtendría en lecturas de disco sin formato:
dd if=/dev/sdb of=/dev/null bs=256k
19701+0 records in
19700+0 records out
5164236800 bytes (5.2 GB) copied, 202.553 s, 25.5 MB/s
Resultados de otras ejecuciones, con un rendimiento muy variable:
18706857984 bytes (19 GB) copied, 1181.51 s, 15.8 MB/s
20923023360 bytes (21 GB) copied, 388.137 s, 53.9 MB/s
21205876736 bytes (21 GB) copied, 55.5997 s, 381 MB/s
25391005696 bytes (25 GB) copied, 153.903 s, 165 MB/s
Actualización 2: Salida de megacli -PDlist -aall: https://gist.github.com/danpelota/3fca1e5f90a1f358c2d52a49bfb08ef0
@Dan, miré los detalles en la
—
Michal Sokolowski
megacli -PDlist -aallsalida y no veo nada obviamente malo allí, smartctl -a -d sat+megaraid,10 /dev/sdbsolo fue un ejemplo, vale la pena probar los contadores SMART, en mi humilde opinión, las alertas SMART rara vez funcionaron para mí, primero encuentro la configuración correcta del módulo para sus unidades usando smartctl --scan, a continuación, sustituir parte sat+megaraid,21licencia /dev/sdasin tocar, no debería cambiar nada de todos modos. Solía seguir así ServeRAID M5015 SAS/SATA Controller, aunque parece la misma mierda. Aquí hay un ejemplo: pastebin.com/WYb8Utxr
@Dan, para mí ese comportamiento todavía consiste en discos "prefailing". Es posible que algún disco recupere casi siempre sus lecturas, lo que ralentiza todo el proceso. Las estadísticas SMART son cruciales para aprobar / rechazar mi teoría. Una vez más, para mí los contadores megaraid no valían nada, no cambió hasta que el disco murió por completo (el estado en que no se inicia en absoluto), he usado SAS similares en términos de proveedor y tamaño.
—
Michal Sokolowski
@MichalSokolowski: Tiene sentido. Obtuve los números de dispositivo correctos y ejecuté
—
danpelota
smartctllos discos individuales. Parece que el recuento de errores no medios es enorme para el disco 18: gist.github.com/danpelota/83b54854aa5af2e351ed71af5c8ebbf5
Me alegra que lo hayas clavado. Por favor, siéntase libre de hacer eso. Lo votaré de todos modos. El aumento de la reputación es solo un efecto secundario. Por favor recuerde hacer una pregunta contestada. Hiciste la mayor parte del trabajo. :) He leído sus estadísticas SMART, pero en la forma actual también son inútiles. Quería ver contadores SMART reales. Extrañamente tu
—
Michal Sokolowski
smartctlno lo muestra como el mío. Hay una respuesta real con seguridad.
dd if=/dev/sdb of=/dev/null bs=256ky ver qué ancho de banda obtienes. Solo asegúrese de no escribir en el dispositivo de disco a menos que desee restaurar sus sistemas de archivos desde la copia de seguridad ...