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Intente: fsck -pvcfforzará una verificación detallada de los bloques defectuosos y la reparará automáticamente. Si aún tiene problemas, su HDD podría tener problemas físicos.
En mi máquina, e2fsck -fv <ext4-device>lleva mucho tiempo, unos dos o cuatro minutos (el dispositivo está lleno en 360 GiB). ¡Así que supongo que hace una verificación completa! Usualmente uso e2fsck -vfp -C0 <ext4-device>"," -phace la reparación automática "," -C0imprime el progreso en stdout y " -v" es para "detallado".