Bueno, después de un pequeño chat en el IRC, la opinión general es que el kernel de Linux comparte algún código entre ipv4 e ipv6, y eso puede hacer que la desactivación por completo de ipv4 sea completamente imposible. Puede intentar compilar el núcleo sin las partes de ipv4, pero es posible que ipv6 no se compile en este caso (¡pero nada le impide intentarlo!).
Puede eliminar las direcciones ipv4 de las interfaces, AFAIK, pero no creo que en este momento sea posible deshabilitar completamente ipv4.
EDITAR: Después de una comprobación rápida make menuconfig
del kernel 2.6.36, no pude encontrar una manera de deshabilitar ipv4 sin deshabilitar toda la pila TCP / IP (y, por lo tanto, ipv6).