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Eso depende: cuando la gente me dice "más rápido y más seguro", eso suena más como una publicidad publicitaria que como un juicio técnico adecuado, pero si puede señalar razones específicas por las que IPv6 será "más rápido y más seguro" para su escenario específico y puede estar seguro de que estos beneficios superarán cualquier costo de realizar el cambio y, por supuesto, hágalo. En otras palabras, ¿IPv6 soluciona un problema que realmente tienes ahora?
Tengo que decir que personalmente no tendría parte de mi red interna usando IPv4 y parte usando IPv6, por lo que para mí la pregunta sería "¿Debería toda mi red interna usar IPv6?". Cualquier aumento de velocidad y seguridad que pueda obtener al hacer parte de la red IPv6 se verá anulado por los costos de soporte de un entorno mixto y IIRC la necesidad de una puerta de enlace IPv6 -> IPv4 en una red mixta tenderá a negar cualquier beneficio técnico.
IPv6 es más seguro, pero para uso interno, no considero que esa seguridad adicional valga especialmente la pena, ya que tengo muchas otras medidas de seguridad implementadas que creo que son más fuertes (firewalls de hardware, IPSec / IPTables, etc.). Personalmente, uso v4 internamente y actualmente hago doble publicidad (4 y 6) de nuestros servicios externos.
Ah, y esta es una buena pregunta por cierto :)