Trato de no comentar en las discusiones de 'guerra santa', pero trataré de ser completamente neutral aquí.
Como administrador de sistemas, soy un pragmático. Utilizo lo que funciona mejor para lo que hago. En mi infraestructura, tengo entre 75 y 100 máquinas Linux y dos servidores Windows. Son los controladores de dominio para mi dominio de directorio activo, que utilizo para autenticar el resto de mis máquinas Linux.
Hay servidores de directorio disponibles para Linux que harían lo que las máquinas Windows hacen por mí, pero a la compañía le cuesta menos comprar licencias y usar Active Directory que aprender a instalar, configurar y administrar esos servicios. Probablemente también haya software de Windows para realizar el otro 98% de lo que hago en Linux.
Es más barato para la compañía usar lo que funciona y lo que sabemos, en lugar de lo que podría funcionar y lo que no sabemos.