¿Combinar 2 árboles de directorios en Linux sin copiar?

Tengo dos árboles de directorio con diseños similares, es decir

.
 |-- dir1
 |   |-- a
 |   |   |-- file1.txt
 |   |   `-- file2.txt
 |   |-- b
 |   |   `-- file3.txt
 |   `-- c
 |       `-- file4.txt
 `-- dir2
     |-- a
     |   |-- file5.txt
     |   `-- file6.txt
     |-- b
     |   |-- file7.txt
     |   `-- file8.txt
     `-- c
         |-- file10.txt
         `-- file9.txt

Me gustaría fusionar los árboles de directorios dir1 y dir2 para crear:

 merged/
 |-- a
 |   |-- file1.txt
 |   |-- file2.txt
 |   |-- file5.txt
 |   `-- file6.txt
 |-- b
 |   |-- file3.txt
 |   |-- file7.txt
 |   `-- file8.txt
 `-- c
     |-- file10.txt
     |-- file4.txt
     `-- file9.txt

Sé que puedo hacer esto usando el comando "cp", pero quiero mover los archivos en lugar de copiarlos, porque los directorios reales que quiero fusionar son realmente grandes y contienen muchos archivos (millones). Si uso "mv", aparece el error "El archivo existe" debido a los nombres de directorio en conflicto.

ACTUALIZACIÓN: puede suponer que no hay archivos duplicados entre los dos árboles de directorios.

rsync -ax --link-dest=dir1/ dir1/ merged/
rsync -ax --link-dest=dir2/ dir2/ merged/

Esto crearía enlaces duros en lugar de moverlos, puede verificar que se movieron correctamente, luego, elimine dir1/y dir2/.

Es extraño que nadie haya notado que cptiene opción -l:

-l, --link
       archivos de enlace duro en lugar de copiar

Puedes hacer algo como

% mkdir merge
% cp -rl dir1 / * dir2 / * fusionar
% rm -r dir *
% fusión de árbol 
unir
├── a
│ ├── archivo1.txt
│ ├── archivo2.txt
│ ├── archivo5.txt
│ └── archivo6.txt
├── b
│ ├── archivo3.txt
│ ├── archivo7.txt
│ └── archivo8.txt
└── c
    ├── file10.txt
    ├── file4.txt
    └── file9.txt

13 directorios, 0 archivos

Puede usar rename (también conocido como prename, del paquete perl) para eso. Tenga en cuenta que el nombre no necesariamente se refiere al comando que describo fuera de debian / ubuntu (aunque es un solo archivo perl portátil si lo necesita).

mv -T dir1 merged
rename 's:^dir2/:merged/:' dir2/* dir2/*/*
find dir2 -maxdepth 1 -type d -empty -delete

También tiene la opción de usar vidir (de moreutils) y editar las rutas de archivo desde su editor de texto preferido.

Me gustan las soluciones de rsync y de nombre , pero si realmente quieres que mv haga el trabajo y

• tu hallazgo sabe -print0y -depth,
• sus xargs sabe -0,
• tienes printf ,

entonces es posible manejar una gran cantidad de archivos que pueden tener espacios en blanco al azar en sus nombres, todos con un script de shell estilo Bourne:

#!/bin/sh

die() {
    printf '%s: %s\n' "${0##*/}" "$*"
    exit 127
}
maybe=''
maybe() {
    if test -z "$maybe"; then
        "$@"
    else
        printf '%s\n' "$*"
    fi
}

case "$1" in
    -h|--help)
        printf "usage: %s [-n] merge-dir src-dir [src-dir [...]]\n" "${0##*/}"
        printf "\n    Merge the <src-dir> trees into <merge-dir>.\n"
        exit 127
    ;;
    -n|--dry-run)
        maybe=NotRightNow,Thanks.; shift
    ;;
esac

test "$#" -lt 2 && die 'not enough arguments'

mergeDir="$1"; shift

if ! test -e "$mergeDir"; then
    maybe mv "$1" "$mergeDir"
    shift
else
    if ! test -d "$mergeDir"; then
        die "not a directory: $mergeDir"
    fi
fi

xtrace=''
case "$-" in *x*) xtrace=yes; esac
for srcDir; do
    (cd "$srcDir" && find . -print0) |
    xargs -0 sh -c '

        maybe() {
            if test -z "$maybe"; then
                "$@"
            else
                printf "%s\n" "$*"
            fi
        }
        xtrace="$1"; shift
        maybe="$1"; shift
        mergeDir="$1"; shift
        srcDir="$1"; shift
        test -n "$xtrace" && set -x

        for entry; do
            if test -d "$srcDir/$entry"; then
                maybe false >/dev/null && continue
                test -d "$mergeDir/$entry" || mkdir -p "$mergeDir/$entry"
                continue
            else
                maybe mv "$srcDir/$entry" "$mergeDir/$entry"
            fi
        done

    ' - "$xtrace" "$maybe" "$mergeDir" "$srcDir"
    maybe false >/dev/null ||
    find "$srcDir" -depth -type d -print0 | xargs -0 rmdir
done

Fuerza bruta bash

#! /bin/bash

for f in $(find dir2 -type f)
do
  old=$(dirname $f)
  new=dir1${old##dir2}
  [ -e $new ] || mkdir $new
  mv $f $new
done

prueba hace esto

# setup 
for d in dir1/{a,b,c} dir2/{a,b,c,d} ; do mkdir -p $d ;done
touch dir1/a/file{1,2} dir1/b/file{3,4} dir2/a/file{5,6} dir2/b/file{7,8} dir2/c/file{9,10} dir2/d/file11

# do it and look
$ find dir{1,2} -type f
dir1/a/file1
dir1/a/file2
dir1/a/file5
dir1/a/file6
dir1/b/file3
dir1/b/file7
dir1/b/file8
dir1/c/file4
dir1/c/file9
dir1/c/file10
dir1/d/file11

He tenido que hacer esto varias veces para árboles de código fuente en diferentes etapas de desarrollo. Mi solución fue usar Git de la siguiente manera:

1. Cree un repositorio git y agregue todos los archivos de dir1.
2. Cometer
3. Elimine todos los archivos y copie en archivos de dir2
4. Cometer
5. Vea las diferencias entre los dos puntos de compromiso y tome decisiones cuidadosas sobre cómo quiero fusionar los resultados.

Puede refinarlo con ramificaciones, etc., pero esta es la idea general. Y tiene menos miedo de rellenarlo porque tiene una instantánea completa de cada estado.