Nuestro servidor WINS principal está programado para ser retirado del servicio, y el servicio WINS se apagó unas semanas antes, desconocido para nosotros (Soporte de red). Comenzamos a obtener usuarios al azar quejándose de que no podían acceder a los recursos de la computadora por su nombre. Descubrimos que la característica común de los dispositivos era que no estaban unidos al dominio de Windows (sin DNS dinámico) y no tenían entradas DNS para sus nombres en nuestros servidores DNS que no son de Windows.
Agregar las entradas DNS solucionó los problemas. Encontré la siguiente página en el sitio de Microsoft muy útil para resolver el problema:
http://support.microsoft.com/kb/172218
En mi trabajo anterior, no tuvimos problemas para deshabilitar NetBIOS por completo, ya que teníamos un departamento que controlaba los servidores, las estaciones de trabajo y la red, por lo que no encontramos un caso en el que los usuarios perdieran la funcionalidad porque nos aseguramos de que todo se resolviera correctamente antes de deshabilitar el Servicio. Recuerdo vagamente haber tenido un problema con uno de nuestros servidores de licencias flexLM porque la versión utilizada era tan antigua que no usaba DNS para resolver nombres. La actualización de la versión solucionó el problema.
Por lo tanto, siempre y cuando se comunique a los usuarios que la funcionalidad está desapareciendo y les haga saber lo que deben hacer para solucionarlo o solucionarlo, no veo ningún problema para eliminarlo.