¿Cómo trazo la superficie de una trama 4D?


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Estoy tratando de trazar la función de onda para una partícula en una caja 3D. Esto me obliga a trazar 4 variables: ejes x, y, z y la función de densidad de probabilidad.

La función de densidad de probabilidad es:

abs((np.sin((p*np.pi*X)/a))*(np.sin((q*np.pi*Y)/b))*(np.sin((r*np.pi*Z)/c)))**2

Estoy usando np.arange()para X, Y y Z.

He leído que para hacer esto necesitas trazar la superficie de una trama 4D. Así es como se supone que debe verse:

ingrese la descripción de la imagen aquí


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¿Qué tal usar un color para representar la densidad de probabilidad?
Shuhao Cao

Me imagino que la opacidad funcionaría bien para este tipo de trama. Es posible que deba proporcionar diferentes perspectivas de cada gráfico, pero hacer que el gráfico sea más opaco donde es probable que esté la partícula visualizaría bien estos datos.
Godric Seer

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Como parece que estás usando numpy, puedes usar mayavi para hacer el trazado real. Los documentos tienen un ejemplo de trazado de datos escalares en 3D .
jorgeca

Respuestas:


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f(x,y,z)

Hay varias formas de visualizar este tipo de datos y muchas herramientas que lo ayudarán. Te mostraré algunos estilos de tramas que puedes hacer.

  1. f(x,y,z)=(const.)

    En Mathematica

    ContourPlot3D[
     Abs[Sin[\[Pi] x] Sin[\[Pi] y] Sin[\[Pi] z]]^2 == 1/2,
     {x, -1, 1}, {y, -1, 1}, {z, -1, 1}]
    

    Mostrar las superficies de probabilidad constante 0.2, 0.5 y 0.8:

    ContourPlot3D[
     Abs[Sin[\[Pi] x] Sin[\[Pi] y] Sin[\[Pi] z]]^2,
     {x, -1, 1}, {y, -1, 1}, {z, -1, 1}, Contours -> {0.2, 0.5, 0.8}, 
     ContourStyle -> (Directive[#, Opacity[0.25]] & /@ {Yellow, Orange, Red}), 
     Lighting -> "Neutral", Mesh -> None]
    

  2. Puede hacer algún tipo de visualización de volumen , posiblemente con recortes y cortes. Podrá asignar un color y una opacidad a cada punto en 3D. Las herramientas más avanzadas también le permitirán elegir una función de transferencia.

    imgdata = 
      Table[Abs[Sin[\[Pi] x] Sin[\[Pi] y] Sin[\[Pi] z]]^2, 
        {x, -1., 1, .01}, {y, -1., 1, .01}, {z, -1., 1, .01}];
    
    img = Image3D[imgdata, ClipRange -> {{150, 200}, {0, 100}, {0, 200}}]
    

    El corte a menudo ayuda, especialmente si puede controlar interactivamente qué corte mostrar.

    Image3DSlices[img, Range[1, 200, 10]]
    

Estos ejemplos fueron concebidos como ideas para los tipos de visualizaciones que puede intentar crear. Hay muchas herramientas gratuitas y comerciales que puedes usar para hacer los trazados.


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El enfoque tradicional para datos basados ​​en campos escalares (temperatura, magnitud de velocidad, presión, densidad, etc.) trazados en dos o tres dimensiones espaciales usa color. Es importante tener en cuenta que la elección del esquema de color puede distorsionar sus impresiones de los datos. Por esta razón, no use un esquema de colores del arco iris. (Por qué, vea aquí , aquí , aquí y aquí .) Desafortunadamente, el arco iris es el esquema de color predeterminado en MATLAB y matplotlib.

Si está tratando de resaltar cambios en la intensidad, usar un esquema que varía en saturación funciona bien, como uno que varía de blanco (densidad cero) a negro (densidad máxima). La transparencia también puede funcionar bien. Un problema complicado con las gráficas tridimensionales cuando se utiliza el color es que necesitará ver los datos desde múltiples perspectivas para obtener una imagen más completa de las tendencias y características; También es posible que necesite trazar rebanadas.


Sí, una trama de color no funcionará, tienes razón. ¿Alguna idea de qué tipo de función usaría para esto entonces?
nabo

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¿Te refieres a una función en Python? Hay algunas bibliotecas por ahí que funcionan bien para trazar. Matplotlib se usa generalmente para gráficos 2D en lugar de gráficos 3D; ggplot y Bokeh tienen casos de uso similares. Mayavi2, como sugirió jorgeca, es bueno para el trazado en 3D. Tiendo a preferir paquetes de software para la visualización de datos en 3D, como ParaView o VisIt. También podría mirar yt (que está basado en Python), y hace un buen trabajo al trazar datos 3D. Cualquier biblioteca de visualización que valga la pena debería darle múltiples opciones para escalas de color, opacidad, saturación, etc.
Geoff Oxberry
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