La herramienta raspi-config, al menos en versiones recientes de Raspbian (19 de septiembre de 2012), le permite mantener presionada la tecla Shift durante el arranque para volver a un estado no overclockeado. Esto funcionó para mí cuando mi dispositivo no terminó de arrancar a 1000MHz.
Ahora puede elegir entre uno de los cinco preajustes de overclock en raspi-config, el más alto de los cuales ejecuta ARM a 1GHz. El nivel de overclock estable que puede lograr dependerá de su Pi específico y de la calidad de su fuente de alimentación; Sugerimos que Quake 3 es una buena prueba de esfuerzo para verificar si un nivel en particular es completamente estable. Si elige un overclock demasiado alto, es posible que su Pi no se inicie, en cuyo caso si mantiene presionada la tecla Mayús durante el inicio, se desactivará el overclock para ese inicio, lo que le permitirá seleccionar un nivel inferior.
Fuente: http://www.raspberrypi.org/archives/2008