Encuentra pares simétricos rápidamente en numpy


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from itertools import product
import pandas as pd

df = pd.DataFrame.from_records(product(range(10), range(10)))
df = df.sample(90)
df.columns = "c1 c2".split()
df = df.sort_values(df.columns.tolist()).reset_index(drop=True)
#     c1  c2
# 0    0   0
# 1    0   1
# 2    0   2
# 3    0   3
# 4    0   4
# ..  ..  ..
# 85   9   4
# 86   9   5
# 87   9   7
# 88   9   8
# 89   9   9
# 
# [90 rows x 2 columns]

¿Cómo encuentro, identifico y elimino rápidamente el último duplicado de todos los pares simétricos en este marco de datos?

Un ejemplo de par simétrico es que '(0, 1)' es igual a '(1, 0)'. Este último debe ser eliminado.

El algoritmo debe ser rápido, por lo que se recomienda usar numpy. La conversión a objetos python no está permitida.


1
¿Podría dar un ejemplo de lo que entiende symmetric pairs?
Yatu

(0, 1) == (1,0) es cierto
The Unfun Cat

1
¿Es (0, 1) == (0, 1) también verdadero?
wundermahn

@JerryM. Sí, pero es trivial eliminar condf.drop_duplicates()
The Unfun Cat

2
@ molibdeno42 Utilizo el producto itertools para crear un ejemplo, los datos en sí mismos no se crean con el producto itertools.
The Unfun Cat

Respuestas:


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Puede ordenar los valores, luego groupby:

a= np.sort(df.to_numpy(), axis=1)
df.groupby([a[:,0], a[:,1]], as_index=False, sort=False).first()

Opción 2 : si tiene muchos pares c1, c2, groupbypuede ser lento. En ese caso, podemos asignar nuevos valores y filtrar por drop_duplicates:

a= np.sort(df.to_numpy(), axis=1) 

(df.assign(one=a[:,0], two=a[:,1])   # one and two can be changed
   .drop_duplicates(['one','two'])   # taken from above
   .reindex(df.columns, axis=1)
)

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Una forma es usar np.uniquecon return_index=Truey usar el resultado para indexar el marco de datos:

a = np.sort(df.values)
_, ix = np.unique(a, return_index=True, axis=0)

print(df.iloc[ix, :])

    c1  c2
0    0   0
1    0   1
20   2   0
3    0   3
40   4   0
50   5   0
6    0   6
70   7   0
8    0   8
9    0   9
11   1   1
21   2   1
13   1   3
41   4   1
51   5   1
16   1   6
71   7   1
...

1
Sí lo contrario única falla para detectar pares simétricos @DanielMesejo
Yatu

Ok, ya veo así que están ordenando las parejas
Dani Mesejo

Sí, pero quiero decir que transformas [1, 0] en [0, 1] ¿verdad?
Dani Mesejo

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frozenset

mask = pd.Series(map(frozenset, zip(df.c1, df.c2))).duplicated()

df[~mask]

1
¿No estás iterando lentamente sobre las tuplas sobre cada columna aquí? Aún así, votar.
The Unfun Cat

Sí, estoy iterando. No, no es tan lento como crees.
piRSquared

5

voy a hacer

df[~pd.DataFrame(np.sort(df.values,1)).duplicated().values]

De pandas y numpy tri

s=pd.crosstab(df.c1,df.c2)
s=s.mask(np.triu(np.ones(s.shape)).astype(np.bool) & s==0).stack().reset_index()

5

Aquí hay uno basado en NumPy para enteros:

def remove_symm_pairs(df):
    a = df.to_numpy(copy=False)
    b = np.sort(a,axis=1)
    idx = np.ravel_multi_index(b.T,(b.max(0)+1))
    sidx = idx.argsort(kind='mergesort')
    p = idx[sidx]
    m = np.r_[True,p[:-1]!=p[1:]]
    a_out = a[np.sort(sidx[m])]
    df_out = pd.DataFrame(a_out)
    return df_out

Si desea mantener los datos del índice tal como están, úselos return df.iloc[np.sort(sidx[m])].

Para números genéricos (ints / floats, etc.), usaremos view-baseduno:

# https://stackoverflow.com/a/44999009/ @Divakar
def view1D(a): # a is array
    a = np.ascontiguousarray(a)
    void_dt = np.dtype((np.void, a.dtype.itemsize * a.shape[1]))
    return a.view(void_dt).ravel()

y simplemente reemplazar el paso para llegar idxcon idx = view1D(b)en remove_symm_pairs.


1

Si esto necesita ser rápido , y si sus variables son enteras, entonces el siguiente truco puede ayudar: v,wsean las columnas de su vector; construir [v+w, np.abs(v-w)] =: [x, y]; luego ordene esta matriz lexicográficamente, elimine los duplicados y finalmente vuelva a asignarla [v, w] = [(x+y), (x-y)]/2.

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