Tuve el mismo problema, pero lo resolví ...... Microsoft tiene una solución para algo similar a esto que realmente funcionó para resolver este problema. puedes visitar esta página http://blogs.msdn.com/b/webdev/archive/2014/11/11/dialog-box-may-be-displayed-to-users-when-opening-projects-in-microsoft -visual-studio-after-installation-of-microsoft-net-framework-4-6.aspx
El problema ocurre después de que instaló Framework 4.5 y / o Framework 4.6. La actualización 5 de Visual Studio 2012 no soluciona el problema, lo intenté primero.
El blog msdn dice lo siguiente: "Después de la instalación de Microsoft .NET Framework 4.6, los usuarios pueden experimentar el siguiente cuadro de diálogo que se muestra en Microsoft Visual Studio al crear un nuevo sitio web o un proyecto de Windows Azure o al abrir proyectos existentes ... .. "
Según el Blog, el diálogo es benigno. simplemente haga clic en Aceptar, el diálogo no afecta a nada ... Los comentarios en el blog sugieren que VS 2015 tiene el mismo problema, quizás incluso peor.