matplotlib / seaborn: primera y última fila cortadas a la mitad del diagrama de mapa de calor

Al trazar mapas de calor con seaborn (y matrices de correlación con matplotlib), la primera y la última fila se cortan por la mitad. Esto sucede también cuando ejecuto este ejemplo de código mínimo que encontré en línea.

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

Las etiquetas en el eje y están en el lugar correcto, pero las filas no están completamente allí.

Hace unos días, funcionó según lo previsto. Desde entonces, instalé texlive-xetex, así que lo eliminé de nuevo, pero no resolvió mi problema.

¿Alguna idea de lo que podría estar perdiendo?

Desafortunadamente, matplotlib 3.1.1 rompió los mapas de calor de seaborn ; y en general ejes invertidos con ticks fijos.
Esto está arreglado en la versión de desarrollo actual; puedes por lo tanto

• volver a matplotlib 3.1.0
• use matplotlib 3.1.2 o superior
• establecer los límites del mapa de calor manualmente ( ax.set_ylim(bottom, top) # set the ylim to bottom, top)

Es un error en la regresión de matplotlib entre 3.1.0 y 3.1.1 Puede corregir esto de la siguiente manera:

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

Se corrigió usando lo anterior y estableciendo los límites del mapa de calor manualmente.

primero

ax = sns.heatmap(...

comprobado los ejes actuales con

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

Fijo con

ax.set_ylim(6.0, 0)

Lo resolví agregando esta línea en mi código, con matplotlib==3.1.1:

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

NÓTESE BIEN. La única razón por la que esto funciona es porque el eje x no cambia, así que úselo bajo su propio riesgo con futuras versiones de mpl.

matplotlib 3.1.2 está disponible: está disponible en la nube de Anaconda a través de conda-forge, pero no pude instalarlo a través de conda install. La alternativa manual funcionó: descargue matplotlib 3.1.2 desde github e instálelo a través de pip

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

Sucede con la versión 3.1.1 de matplotlib como sugiere la importancia de beingernest

Seguir resolvió mi problema

pip install matplotlib==3.1.0

rustyDev tiene razón sobre conda-forge, pero no necesitaba hacer una instalación manual de pip desde una descarga de github. Para mí, en Windows, funcionó directamente. Y las parcelas vuelven a ser bonitas.

https://anaconda.org/conda-forge/matplotlib

conda install -c conda-forge matplotlib

puntos opcionales, no necesarios para la respuesta:

Luego, probé otros pasos, pero no son necesarios: En el indicador de conda: conda search matplotlib --info no mostró información de nueva versión, la información más reciente fue para 3.1.1. Por lo tanto, probé pip usando pip install matplotlib==3.1.2Pero pip dice "Requisito ya satisfecho"

Luego, obtener la versión de acuerdo con medium.com/@rakshithvasudev/… python - import matplotlib - matplotlib.__version__muestra que 3.1.2 se instaló correctamente

Por cierto, tuve este error directamente después de actualizar Spyder a v4.0.0. El error estaba en un diagrama de una matriz de confusión. Esto ya se mencionó hace algunos meses. stackoverflow.com/questions/57225685/… que ya está vinculado a esta pregunta nacida del mar.

conda install matplotlib = 3.1.0

Esto funcionó para mí y degradó matplotlib de 3.1.1 a 3.1.0 y los mapas de calor comenzaron a comportarse correctamente

Resolví este problema con el siguiente código: