Una URL relativa a la raíz comienza con un /carácter, para parecerse a algo así <a href="https://stackoverflow.com/directoryInRoot/fileName.html">link text</a>.
El enlace que publicó: <a href="fruits/index.html">Back to Fruits List</a>se vincula a un archivo html ubicado en un directorio llamado fruits, el directorio está en el mismo directorio que la página html en la que aparece este enlace.
Para convertirlo en una URL relativa a la raíz, cámbiela a:
<a href="/fruits/index.html">Back to Fruits List</a>
Editado en respuesta a la pregunta, en comentarios, de OP:
Al hacerlo / lo haré relativo a www.example.com, ¿hay alguna manera de especificar cuál es la raíz, por ejemplo, qué pasa si quiero que la raíz sea www.example.com/fruits en www.example.com/fruits/ manzanas / manzana.html?
Sí, al anteponer la URL, en los atributos hrefo src, con a /hará que la ruta sea relativa al directorio raíz. Por ejemplo, dada la página html en www.example.com/fruits/apples.html, la ade href="https://stackoverflow.com/vegetables/carrots.html"vinculará a la página www.example.com/vegetables/carrots.html.
El elemento de baseetiqueta le permite especificar la base-uri para esa página (aunque la baseetiqueta debería agregarse a cada página en la que fuera necesario utilizar una base específica, para esto simplemente citaré el ejemplo de W3:
Por ejemplo, dada la siguiente declaración BASE y la declaración A:
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01//EN"
"http://www.w3.org/TR/html4/strict.dtd">
<HTML>
<HEAD>
<TITLE>Our Products</TITLE>
<BASE href="http://www.aviary.com/products/intro.html">
</HEAD>
<BODY>
<P>Have you seen our <A href="../cages/birds.gif">Bird Cages</A>?
</BODY>
</HTML>
el URI relativo "../cages/birds.gif" resolvería:
http://www.aviary.com/cages/birds.gif
Ejemplo citado de: http://www.w3.org/TR/html401/struct/links.html#h-12.4 .
Lectura sugerida:
/hará que sea relativa awww.example.com, ¿hay una forma de especificar cuál es la raíz es, por ejemplo, lo que si quiero que la raíz eswww.example.com/fruitsenwww.example.com/fruits/apples/apple.html?