En la delantera ... Soy un committer de Hudson y autor del libro de Hudson, pero no participé en la división completa de los proyectos.
En cualquier caso, aquí está mi consejo:
Eche un vistazo a ambos y vea qué se adapta mejor a sus necesidades
Hudson completará la migración para convertirse en un proyecto de Eclipse de alto nivel a finales de este año y ha conseguido que un montón de desarrolladores a tiempo completo, QA y otros trabajen en el proyecto. Sigue siendo fuerte y tiene muchos usuarios y, al ser el servidor CI predeterminado en Eclipse, continuará satisfaciendo las necesidades de muchos desarrolladores de Java. Mirando la hoja de ruta y los planes para el futuro, puede ver que después de la integración de Maven 3 lograda con la versión 2.1.0, hay muchas otras características interesantes por delante.
http://www.eclipse.org/hudson
Jenkins, por otro lado, se ha ganado muchos usuarios originales de Hudson y tiene una gran comunidad de usuarios a través de múltiples tecnologías y también tiene un montón de desarrolladores trabajando en ello.
En esta etapa, ambos servidores CI son excelentes herramientas para usar y, dependiendo de sus necesidades en términos de tecnología para integrarse con uno u otro, podría ser mejor. Ambos productos están disponibles como código abierto y puede obtener soporte comercial de varias compañías para ambos.
En cualquier caso ... si aún no está utilizando un servidor CI ... comience ahora con cualquiera de ellos y verá grandes beneficios.
Actualización de enero de 2013: después de un largo proceso de limpieza de IP y nuevas mejoras, Hudson 3.0 ya está disponible la primera versión aprobada por la fundación Eclipse.