Parece que el eclipse ha cambiado un poco
pero el siguiente método que funcionó para mí parece muy al anterior.
La solución consta de 2 pasos:
Primero tienes que actualizar las preferencias de Eclipse ( Window > Preferences):

Asegúrese de marcar ambos Manualy al Buildlado de lo Validatorque necesita
(en mi caso, uno de javascript).
Por último, debe cambiar los validadores de su proyecto :

Haga clic en Client-side JavaScript Settings(o cualquier otro validador que necesite):

La explicación es clara pero básicamente lo que debes hacer es la siguiente:
Haga clic en Add Exclude Group..., selecciónelo y luego haga clic en Add rule....
Luego elija Folder or file name(tenga en cuenta que hay otras opciones) y especifique su archivo / carpeta.
Debería poder verificar que está funcionando eliminando los errores / advertencias existentes,
y luego haga clic izquierdo en su proyecto y seleccione elValidate opción.
Esta configuración también se puede asignar al control de código fuente.