No estoy seguro de que sea la mejor manera, pero ciertamente puede reemplazar las etiquetas de marca de esta manera:
import matplotlib.pyplot as plt
x = range(10)
y = range(10)
plt.plot(x,y)
plt.xticks(x," ")
plt.show()
En Python 3.4, esto genera una gráfica de línea simple sin etiquetas de marca en el eje x. Un ejemplo simple está aquí:
http://matplotlib.org/examples/ticks_and_spines/ticklabels_demo_rotation.html
Esta pregunta relacionada también tiene algunas sugerencias mejores:
Ocultar el texto del eje en diagramas de matplotlib
Soy nuevo en Python. Su kilometraje puede variar en versiones anteriores. ¿Quizás otros puedan ayudar?