Esto ya está implementado en las bibliotecas en tiempo de ejecución.
public static String calc(InputStream is) {
String output;
int read;
byte[] buffer = new byte[8192];
try {
MessageDigest digest = MessageDigest.getInstance("SHA-256");
while ((read = is.read(buffer)) > 0) {
digest.update(buffer, 0, read);
}
byte[] hash = digest.digest();
BigInteger bigInt = new BigInteger(1, hash);
output = bigInt.toString(16);
while ( output.length() < 32 ) {
output = "0"+output;
}
}
catch (Exception e) {
e.printStackTrace(System.err);
return null;
}
return output;
}
En un entorno JEE6 + también se podría utilizar JAXB DataTypeConverter :
import javax.xml.bind.DatatypeConverter;
String hash = DatatypeConverter.printHexBinary(
MessageDigest.getInstance("MD5").digest("SOMESTRING".getBytes("UTF-8")));