Programación de script R

He escrito un script R que extrae algunos datos de una base de datos, realiza varias operaciones en él y publica el resultado en una nueva base de datos.

Me gustaría que este script se ejecutara todos los días a una hora específica, pero no puedo encontrar ninguna forma de hacerlo de manera efectiva.

¿Alguien puede recomendar un recurso que pueda consultar para resolver este problema? Estoy ejecutando este script en una máquina con Windows.

En realidad, en Windows, ni siquiera tiene que crear un archivo por lotes primero para usar el Programador .

• Abra el programador: INICIO -> Todos los programas -> Accesorios -> Herramientas del sistema -> Programador
• Crear una nueva tarea
• en la pestaña Acción, crea una nueva acción
• elija Iniciar programa
• busque Rscript.exe que debe colocarse, por ejemplo, aquí:
  "C: \ Archivos de programa \ R \ R-3.0.2 \ bin \ x64 \ Rscript.exe"
• ingrese el nombre de su archivo en el campo de parámetros
• ingrese la ruta donde se encuentra el script en el campo Comenzar en
• vaya a la pestaña Activadores
• crear un nuevo disparador
• elige que tarea se debe hacer cada día , mes, ... repetida varias veces, o lo que quieras

Suponiendo que su script R está mytest.rubicado en D:\mydocuments\, puede crear un archivo por lotes que incluya el siguiente comando:

C:\R\R-2.10.1\bin\Rcmd.exe BATCH D:\mydocuments\mytest.r

Luego agréguelo, como una nueva tarea, al programador de tareas de Windows, estableciendo allí las condiciones de activación.

También puede omitir el archivo por lotes. Establezca C:\R\R-2.10.1\bin\Rcmd.exeen el program/scriptcuadro de texto en el programador de tareas y proporcione Argumentsel resto del comando inicial:BATCH D:\mydocuments\mytest.r

Programación de tareas de R a través del programador de tareas de Windows (publicado el 11 de febrero de 2015)

taskscheduleR: paquete R para programar scripts R con el administrador de tareas de Windows (publicado el 17 de marzo de 2016)

EDITAR

Recientemente adopté nuevamente el uso de archivos por lotes, porque quería que la ventana de cmd se minimizara (no pude encontrar otra manera).

Específicamente, lleno la Actionspestaña del programador de tareas de Windows de la siguiente manera:

Program/script:

cmd.exe

Add arguments (optional):

/ c inicio / min D: \ mydocuments \ mytest.bat ^ & salir

Contenido de mytest.bat :

C: \ R \ R-3.5.2 \ bin \ x64 \ Rscript.exe D: \ mydocuments \ mytest.r params

Ahora hay una opción incorporada en RStudio para hacer esto, para ejecutar el programador primero instale los siguientes paquetes

  install.packages('data.table')
  install.packages('knitr')
  install.packages('miniUI')
  install.packages('shiny')
  install.packages("taskscheduleR", repos = "http://www.datatailor.be/rcube", type = 
  "source")

Después de la instalación, vaya a

**TOOLS -> ADDINS ->BROWSE ADDINS ->taskscheduleR -> Select it and execute it.**

Configuré mis tareas a través del SCHTASKSprograma. Para ejecutar scripts en el inicio, escribiría algo como

SCHTASKS /Create /SC ONSTART /TN MyProgram /TR "R CMD BATCH --vanilla d:\path\to\script.R"

Consulte este sitio web para obtener más detalles sobre SCHTASKS. Más detalles en el sitio web de Microsoft .

Puede utilizar el Programador de tareas de Windows .

Configurar el programador de tareas

Paso 1) Abra el programador de tareas (Inicio> buscar Programador de tareas)

Paso 2) Haga clic en "Acción"> "Crear tarea"

Paso 3) Seleccione "Ejecutar solo cuando el usuario haya iniciado sesión", desmarque "Ejecutar con los más altos privilegios", asigne un nombre a su tarea, configure para "Windows Vista / Windows Server 2008"

Paso 4) En la pestaña "Activadores", establezca cuándo desea que se ejecute el script

Paso 5) En la pestaña "Acciones", coloque la ubicación completa del archivo Rscript.exe, es decir

"C:\Program Files\R\R-3.6.2\bin\Rscript.exe" (include the quotes)

Ponga el nombre de su script con -ey source()en argumentos envolviéndolo así:

-e "source('C:/location_of_my_script/test.R')"

Solución de problemas de un Rscript programado en el Programador de tareas

Cuando ejecuta un script con el Programador de tareas, es difícil solucionar cualquier problema porque no recibe ningún mensaje de error.

Esto se puede resolver usando la sink()función en R que le permitirá enviar todos los mensajes de error a un archivo que usted especifique. Así es como puede hacer esto:

# Set up error log ------------------------------------------------------------
error_log <- file("C:/location_of_my_script/error_log.Rout", open="wt")
sink(error_log, type="message")

try({

# insert your code here

})

La otra cosa que tendrá que cambiar para que su Rscript funcione es especificar la ruta de archivo completa de cualquier ruta de archivo en su secuencia de comandos.

Esto no funcionará en el programador de tareas:

source("./functions/import_function.R")

Deberá especificar la ruta completa del archivo de cualquier script que esté obteniendo dentro de su Rscript:

source("C:/location_of_my_script/functions/import_function.R")

Después de seguir cualquier combinación de estos pasos y recibe el "Argument Batch Ignored"error después de que se ejecuta R.exe, intente esto, funcionó para mí.

En el Programador de tareas de Windows:

Reemplazar BATCH "C:\Users\desktop\yourscript.R"en el campo de argumentos

con

CMD BATCH --vanilla --slave "C:\Users\desktop\yourscript.R"