Respuestas:
La respuesta está cerca, en el menú de engranajes del Proyecto:

PD: Sí, es una publicación de autoaprendizaje.
Además, es posible que haya activado la Show Excluded Filesopción. Si es así, use Shift+ Shifty escriba excluido y haga lo obvio.

Reopenesta configuración parezca restablecerse, pero si abrieras tu proyecto por Openopción, funcionaría correctamente. Debería escribir al soporte de IntelliJ, creo.
Projectvista, ahora está debajo de la Project Filesvista; es decir, para ocultar los archivos, debe usar el menú desplegable en la parte superior para cambiar Project Files.
Haga clic derecho en el directorio que desea excluir para marcarlo como excluido
, y luego desmarque la Show Excluded Filesopción.

1: Intellij IDEA> Preferencias.
2: Vaya a Tipos de archivo.
3: Agregue * .iml y * .idea al cuadro de lista Ignorar archivos y carpetas en la parte inferior de esta ventana.
File -> Settings -> Editor -> File Types