Reordenar barras en geom_bar ggplot2


119

Estoy tratando de hacer un diagrama de barras donde el diagrama está ordenado desde miRNAel más alto valuehasta miRNAel más bajo. ¿Por qué no funciona mi código?

> head(corr.m)

        miRNA         variable value
1    mmu-miR-532-3p      pos     7
2    mmu-miR-1983        pos    75
3    mmu-miR-301a-3p     pos    70
4    mmu-miR-96-5p       pos     5
5    mmu-miR-139-5p      pos    10
6    mmu-miR-5097        pos    47

ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) + 
  geom_bar(stat="identity")

Respuestas:


216

Su código funciona bien, excepto que el diagrama de barras está ordenado de menor a mayor. Cuando quiera ordenar las barras de mayor a menor, deberá agregar un -letrero antes value:

ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

lo que da:

ingrese la descripción de la imagen aquí


Datos usados:

corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
                         variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
                         value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
                    class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))

no se ordena en mi trama por alguna razón
user3741035

@ user3741035 Extraño. ¿Lo usó en el conjunto de datos de muestra que proporcionó anteriormente o en el conjunto de datos completo?
Jaap

¿Qué versión de R & ggplot estás usando? ¿También puede privar de un conjunto de datos de muestra más grande (preferiblemente con más de un valor para variable)?
Jaap

6
encontré la solución: había cargado la biblioteca (gplots) que estropeó las cosas
user3741035

1
@maycca Me está dando el resultado correcto (en OSX 10.10.4 / Windows 7, R 3.2.3 y ggplot2 2.1.0). ¿Quizás deberías empezar con una nueva sesión?
Jaap
Al usar nuestro sitio, usted reconoce que ha leído y comprende nuestra Política de Cookies y Política de Privacidad.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.