Simplemente me pregunto si es mejor poner todos mis proyectos de Eclipse en un espacio de trabajo o hacer un espacio de trabajo por cada proyecto. Solo soy un desarrollador en solitario, por afición más o menos, pero las aplicaciones que creo tienen versiones de producción que se ejecutan en trabajos cron bastante frecuentes, por lo que es casi como un entorno de producción amateur.
Los únicos problemas que he notado hasta ahora son para exportar archivos JAR, tengo el potencial de incluir archivos fuente de otros proyectos, lo que parece que podría complicarse.