Estoy usando RStudio para escribir documentos con rebajas y quiero agregar una tabla de contenido (TOC) en la parte superior de los documentos para que el usuario pueda hacer clic en la sección relevante para leer. Hubo algunos ejemplos relevantes en rpubs pero ahora parece que no puedo encontrarlos. Tenga en cuenta que no uso pandocy soy bastante nuevo en Rmd& knitr. ¿Hay alguna forma de agregar TOC sin usar pandoc? Si el uso pandoces obligatorio, ¿qué funciones son relevantes?

EDITAR

Aquí hay una pequeña página de muestra:

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title: "Sample Document"
output:
  html_document:
    toc: true
    theme: united
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Header 1
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This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
    
## Header 2
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
    
```{r}
summary(cars)
```

You can also embed plots, for example:

```{r, echo=FALSE}
plot(cars)
```
### Header 3
Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

Intenté ejecutar esto en RStudio v 0.98.864 y funcionó. pero lamentablemente no funcionó en 0.98.501 y 0.98.507. Estoy trabajando en mi tesis en 0.98.501 y después de actualizar RStudio, algunos de mis análisis no funcionaron. Entonces, volví a 0.98.501. ¿Qué debería hacer ahora? Realmente quiero TOC pero sin dañar los resultados de otros análisis.

La sintaxis es

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title: "Sample Document"
output:
  html_document:
    toc: true
    theme: united
---

en la documentación . Asegúrese de que esté al principio de su documento. También asegúrese de que su documento realmente tenga encabezados, de lo contrario, R no puede decir lo que quiere en la tabla de contenido.

Sintaxis con más opciones:

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title: "Planets"
author: "Manoj Kumar"
date: "`r format(Sys.time(), '%B %d, %Y')`"
output: 
  html_document:
    toc: true # table of content true
    toc_depth: 3  # upto three depths of headings (specified by #, ## and ###)
    number_sections: true  ## if you want number sections at each table header
    theme: united  # many options for theme, this one is my favorite.
    highlight: tango  # specifies the syntax highlighting style
    css: my.css   # you can add your custom css, should be in same folder
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Si está utilizando pdf_document, es posible que desee agregar una tabla de contenido en una página nueva, lo toc: trueque no permite. Coloca la tabla de contenido justo después del título del documento, el autor y la fecha, porque está en yaml.

Si quieres tenerlo en una nueva página, tienes que usar algún lenguaje de látex. Aquí esta lo que hice.

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title: \vspace{3.5in}"Title"
author: "Name"
date: "`r Sys.Date()`"
output:
   pdf_document:
      fig_caption: true
      number_sections: true
---

\newpage # adds new page after title
\tableofcontents # adds table of contents
\listoffigures
\listoftables
\newpage

Entonces, después de yaml (el fragmento entre ---), agregué una nueva página usando \newpage, luego una tabla de contenido usando \tableofcontents, una lista de figuras usando \listoffigures, una lista de tablas \listoftablesy una nueva página antes que todo lo demás.

Tenga \vspace{3in}en cuenta que en el título se agrega un espacio vertical de 3 pulgadas desde la parte superior antes de imprimir yaml (título, etc.).

Lea más aquí: https://www.sharelatex.com/learn/Table_of_contents