Quiero buscar archivos que terminen con _peaks.bed, pero excluir archivos en las carpetas tmpy scripts.
Mi comando es así:
find . -type f \( -name "*_peaks.bed" ! -name "*tmp*" ! -name "*scripts*" \)
Pero no funcionó. Los archivos tmpy la scriptcarpeta se seguirán mostrando.
¿Alguien tiene ideas sobre esto?
Respuestas:
Así es como puede especificar eso con find:
find . -type f -name "*_peaks.bed" ! -path "./tmp/*" ! -path "./scripts/*"
Explicación:
find . - Iniciar la búsqueda desde el directorio de trabajo actual (de forma recursiva de forma predeterminada)-type f- Especifique findque solo desea archivos en los resultados-name "*_peaks.bed" - Busque archivos cuyo nombre termine en _peaks.bed! -path "./tmp/*" - Excluir todos los resultados cuya ruta comience con ./tmp/! -path "./scripts/*" - También excluir todos los resultados cuya ruta comience con ./scripts/Prueba de la solución:
$ mkdir a b c d e
$ touch a/1 b/2 c/3 d/4 e/5 e/a e/b
$ find . -type f ! -path "./a/*" ! -path "./b/*"
./d/4
./c/3
./e/a
./e/b
./e/5
Estuviste bastante cerca, la -nameopción solo considera el nombre de base, donde as -pathconsidera la ruta completa =)
find, pero dado que la pregunta está etiquetada como Linux, eso no es un problema. Buena respuesta.
.en el indicador de búsqueda inicial, debe usarlo en cada ruta que excluya. La coincidencia de rutas es bastante estricta, no realiza búsquedas difusas. Entonces, si lo usas, find / -type f -name *.bed" ! -path "./tmp/"no va a funcionar. necesitas tener ! -path "/tmp"que hacerlo feliz.
$ ! -path "./directory/*"
-prunelugar de comprobar todos los archivos del árbol". Si sus directorios excluidos son muy profundos o tienen toneladas de archivos y le importa el rendimiento, utilice la -pruneopción en su lugar.
Aquí hay una forma en que puede hacerlo ...
find . -type f -name "*_peaks.bed" | egrep -v "^(./tmp/|./scripts/)"
findGNU, y no solo con GNU find. Sin embargo, la pregunta está etiquetada como Linux, por lo que no es crítica.
Utilizar
find \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -o -name "*_peaks.bed" -print
o
find \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -false -o -name "*_peaks.bed"
o
find \( -path "./tmp" -path "./scripts" \) ! -prune -o -name "*_peaks.bed"
El orden es importante. Evalúa de izquierda a derecha. Comience siempre con la exclusión del camino.
No utilice -not(o !) para excluir todo el directorio. Utilice -prune. Como se explica en el manual:
−prune The primary shall always evaluate as true; it
shall cause find not to descend the current
pathname if it is a directory. If the −depth
primary is specified, the −prune primary shall
have no effect.
y en el manual de búsqueda de GNU:
-path pattern
[...]
To ignore a whole
directory tree, use -prune rather than checking
every file in the tree.
De hecho, si usa -not -path "./pathname", find evaluará la expresión para cada nodo debajo "./pathname".
Las expresiones de búsqueda son solo evaluación de condiciones.
\( \)- Operación de grupos (puede usar -path "./tmp" -prune -o -path "./scripts" -prune -o, pero es más detallado).-path "./script" -prune- si -pathdevuelve verdadero y es un directorio, devuelve verdadero para ese directorio y no descienda a él.-path "./script" ! -prune- se evalúa como (-path "./script") AND (! -prune). Revierte el "siempre verdadero" de podar a siempre falso. Evita imprimir "./script"como un partido.-path "./script" -prune -false- dado que -prunesiempre devuelve verdadero, puede seguirlo con -falsepara hacer lo mismo que !.-o- Operador OR. Si no se especifica ningún operador entre dos expresiones, el valor predeterminado es el operador AND.Por lo tanto, \( -path "./tmp" -o -path "./scripts" \) -prune -o -name "*_peaks.bed" -printse expande a:
[ (-path "./tmp" OR -path "./script") AND -prune ] OR ( -name "*_peaks.bed" AND print )
La impresión es importante aquí porque sin ella se expande a:
{ [ (-path "./tmp" OR -path "./script" ) AND -prune ] OR (-name "*_peaks.bed" ) } AND print
-printse agrega mediante buscar; es por eso que la mayoría de las veces, no es necesario agregarlo en su expresión. Y dado que -prunedevuelve verdadero, imprimirá "./script" y "./tmp".
No es necesario en los demás porque cambiamos -prunepara devolver siempre falso.
Sugerencia: puede usar find -D opt expr 2>&1 1>/dev/nullpara ver cómo se optimiza y expande,
find -D search expr 2>&1 1>/dev/nullpara ver qué ruta está marcada.
para mí, esta solución no funcionó en un comando ejecutivo con find, realmente no sé por qué, así que mi solución es
find . -type f -path "./a/*" -prune -o -path "./b/*" -prune -o -exec gzip -f -v {} \;
Explicación: igual que sampson-chen uno con las adiciones de
-prune - ignora la ruta de procedimiento de ...
-o - Entonces, si no coincide, imprima los resultados (pode los directorios e imprima los resultados restantes)
18:12 $ mkdir a b c d e
18:13 $ touch a/1 b/2 c/3 d/4 e/5 e/a e/b
18:13 $ find . -type f -path "./a/*" -prune -o -path "./b/*" -prune -o -exec gzip -f -v {} \;
gzip: . is a directory -- ignored
gzip: ./a is a directory -- ignored
gzip: ./b is a directory -- ignored
gzip: ./c is a directory -- ignored
./c/3: 0.0% -- replaced with ./c/3.gz
gzip: ./d is a directory -- ignored
./d/4: 0.0% -- replaced with ./d/4.gz
gzip: ./e is a directory -- ignored
./e/5: 0.0% -- replaced with ./e/5.gz
./e/a: 0.0% -- replaced with ./e/a.gz
./e/b: 0.0% -- replaced with ./e/b.gz
find . -path ./scripts -prune -name '*_peaks.bed' -type f. No estoy seguro de cómo excluir varios directorios. Esto también enumera el directorio excluido de nivel superior aunque typeesté especificado. La exclusión a través de Grep parece más sencilla a menos que desee utilizar Prune para acelerar la operación de búsqueda.
Puedes probar a continuación:
find ./ ! \( -path ./tmp -prune \) ! \( -path ./scripts -prune \) -type f -name '*_peaks.bed'
_peaks.bed.