Respuestas:
El segundo parámetro de findBy
es para ORDER.
$ens = $em->getRepository('AcmeBinBundle:Marks')
->findBy(
array('type'=> 'C12'),
array('id' => 'ASC')
);
array('priority'=>'ASC','id'=>'ASC')
.
findBy
se usa para la escena de consulta básica, para una escena más complicada, use query en su lugar. como $qb = $em->getRepository('AcmeBinBundle:Marks')->createQueryBuilder('m')->...
.