Me gustaría usar una computadora portátil IPython como una forma de analizar de forma interactiva algunas cartas genómicas que estoy haciendo con el GenomeDiagram
módulo de Biopython . Si bien existe una amplia documentación sobre cómo usar matplotlib
para obtener gráficos en línea en el cuaderno de IPython, GenomeDiagram usa el kit de herramientas ReportLab, que no creo que sea compatible con los gráficos en línea en IPython.
Sin embargo, estaba pensando que una forma de evitar esto sería escribir el diagrama de la trama / genoma en un archivo y luego abrir la imagen en línea que tendría el mismo resultado con algo como esto:
gd_diagram.write("test.png", "PNG")
display(file="test.png")
Sin embargo, no puedo entender cómo hacer esto, o saber si es posible. Entonces, ¿alguien sabe si las imágenes se pueden abrir / mostrar en IPython?
from IPython.display import Image
debería funcionar desde 0.13.